胃癌深度测序揭示与个性化医疗相关的体细胞突变 [Affymetrix SNP 阵列数据]

50例胃腺癌样本的Affymetrix SNP V6阵列基因型与拷贝数数据,用于体细胞突变及个性化医疗相关研究。

NIAID Data Ecosystem
浏览 4
基因组Genome variation profiling by SNP arrayGPL68019606
Deep sequencing of gastric carcinoma reveals somatic mutations relevant to personalized medicine [Affymetrix SNP array data]

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

胃癌深度测序揭示与个性化医疗相关的体细胞突变 [Affymetrix SNP 阵列数据]

【一句话概览】

该数据集围绕胃癌深度测序展开,标题显示其揭示与个性化医疗相关的体细胞突变,并标注为 Affymetrix SNP array 数据。源站原始描述指出,胃癌是全球第二大癌症相关死亡原因,大部分健康负担由经济欠发达地区承担。数据集含 1 个文件,标签包括 Genome variation profiling by SNP array、GPL6801 和 9606(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Deep sequencing of gastric carcinoma reveals somatic mutations relevant to personalized medicine [Affymetrix SNP array data]》。源站首次发布:Jun 15 201。

【数据内容】

源站原始描述:Background: Globally, gastric cancer is the second most common cause of cancer-related death, with the majority of the health burden borne by economically less-developed countries

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):背景:在全球范围内,胃癌是第二大癌症致死原因,其中大部分疾病负担由经济欠发达国家承担。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Genome variation profiling by SNP array、GPL6801、9606。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE29996

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 27 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE29996

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案