晚期胃癌恶性腹水单细胞RNA-seq与外显子组样本
该数据集来自omicsdi.org，聚焦晚期胃癌患者的恶性腹水与脑脊液转移样本。研究获取了5例恶性腹水和1例脑脊液，利用Fluidigm C1 System对来自4例恶性腹水和1例脑脊液转移的180个细胞进行单细胞RNA-seq分析，同时从血液或肿瘤组织生成全外显子测序数据
基本信息
资源简介
晚期胃癌恶性腹水单细胞RNA-seq与外显子组样本
该数据集聚焦于晚期胃癌患者的恶性腹水及脑脊液转移样本，旨在定义恶性腹水的细胞特征并探索治疗策略。研究共获取了5例恶性腹水和1例脑脊液样本，这些样本来自五名胃癌患者。在单细胞层面，研究者利用Fluidigm® C1™ System对来自4例恶性腹水和1例脑脊液转移的180个细胞进行了单细胞RNA-seq分析，同时从血液或肿瘤组织生成了全外显子测序数据。数据集收录于omicsdi.org，分类为肿瘤/胃癌，主题标签为Genomics。该数据集为理解晚期胃癌恶性腹水的细胞组成及潜在治疗靶点提供了单细胞转录组与全外显子测序层面的基础资源。
【数据集背景】
该数据集来源于omicsdi.org，属于肿瘤领域中胃癌方向的研究资源。晚期胃癌常伴随恶性腹水及脑脊液转移，这些转移灶的细胞特征与治疗策略是临床与基础研究关注的重点。为定义恶性腹水的细胞特性并寻找治疗策略，研究者采集了五名胃癌患者的样本，包括5例恶性腹水和1例脑脊液，并开展了单细胞RNA-seq与全外显子测序。该数据集的主题标签为Genomics，反映了其以基因组学与转录组学技术为核心的研究属性。
【数据内容】
数据集包含两类主要数据：单细胞RNA-seq数据和全外显子测序数据。单细胞RNA-seq数据来自4例恶性腹水和1例脑脊液转移样本，共涉及180个细胞，使用Fluidigm® C1™ System进行分析。全外显子测序数据则从血液或肿瘤组织生成。样本层面，研究共获取了5例恶性腹水和1例脑脊液，这些样本来自五名胃癌患者。数据集英文名称为“02b257bb-cbf1-4938-8500-1b4510ac4b9d - samples”，本站分类为肿瘤/胃癌。
【采集与来源】
样本采集自五名胃癌患者，包括5例恶性腹水和1例脑脊液。单细胞RNA-seq分析针对其中4例恶性腹水和1例脑脊液转移样本进行，共180个细胞。全外显子测序数据从血液或肿瘤组织生成。数据来源站为omicsdi.org。源站描述中提及使用Fluidigm® C1™ System进行单细胞分析。关于样本采集的具体时间、地点、患者临床信息及伦理审批细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于晚期胃癌恶性腹水及脑脊液转移的细胞特征研究，可用于探索恶性腹水中的细胞异质性、单细胞转录组特征以及潜在的治療策略。全外显子测序数据可用于分析血液或肿瘤组织中的基因组变异。主题标签Genomics表明其适用于基因组学相关分析。由于包含单细胞RNA-seq与全外显子测序，该数据集可能支持肿瘤微环境、转移机制及候选靶点等方向的研究。具体适用场景的详细说明，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过omicsdi.org获取。单细胞RNA-seq数据基于Fluidigm® C1™ System生成，全外显子测序数据来自血液或肿瘤组织。使用者可根据研究目的对180个细胞的单细胞转录组数据及全外显子测序数据进行再分析。关于数据下载格式、预处理流程、分析工具推荐及具体操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集样本量较小，包括5例恶性腹水和1例脑脊液，单细胞RNA-seq分析覆盖4例恶性腹水和1例脑脊液转移的180个细胞。全外显子测序数据来自血液或肿瘤组织。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、细胞过滤标准及批次效应等信息，源站未提供。此外，患者临床特征、随访信息及样本处理细节亦未在源站描述中说明。使用时应考虑样本量有限带来的限制。
【引用与许可】
该数据集的来源站为omicsdi.org。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款及版权信息，源站未提供。使用者应直接访问omicsdi.org以获取相关引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005740
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为明确晚期胃癌患者恶性腹水的细胞特征并探索治疗策略，我们采集了5例胃癌患者的5份恶性腹水和1份脑脊液样本。利用Fluidigm® C1™系统，我们对来自4份恶性腹水和1份脑脊液转移灶的180个细胞进行了单细胞RNA测序数据分析。同时，还从血液或肿瘤组织中生成了全外显子测序数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
