GSE42677皮肤鳞状细胞癌侵袭特征数据集

基于激光显微切割和表达芯片,覆盖光化性角化病、原位鳞癌、侵袭性皮肤鳞癌及正常皮肤样本。由Mount Sinai School of Medicine提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含25条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的皮肤鳞状细胞癌研究。

Mount Sinai School of MedicineMount Sinai School of Medicine
Gene Expression Omnibus
2019-06-18 更新
浏览 10
表格分类Expression profiling by arrayGPL5719606
GSE42677 Invasion Signature at the Leading Edge of Cutaneous Squamous Cell Carcinoma

基本信息

模态
表格
大小
0.07 GB
数据量
25
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-06-18

资源简介

GSE42677皮肤鳞状细胞癌侵袭特征数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Defining an invasion signature at the leading edge of cutaneous squamous cell carcinoma (SCC): IL-24 driven MMP-7 and MMP-13 expression.》。源站首次发布:Dec 03 201。

【数据内容】

源站原始描述:Purpose: Primary cutaneous squamous cell carcinoma (SCC) can be an invasive cancer in skin and has the potential to metastasize. We aimed to define the cancer related molecular changes that distinguish non-invasive from invasive SCC

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL571、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42677

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 18 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42677

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.07 GB。

数据说明

基于激光显微切割和表达芯片,覆盖光化性角化病、原位鳞癌、侵袭性皮肤鳞癌及正常皮肤样本。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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