GSE139505皮肤鳞状细胞癌转录组变化数据集
包含9例原发性皮肤鳞状细胞癌和7例健康皮肤样本的全转录组测序数据,用于差异表达和非编码RNA分析。由Karolinska Institutet提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含16条数据记录,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
GSE139505皮肤鳞状细胞癌转录组变化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Comprehensive analysis of transcriptomic changes in cutaneous squamous cell carcinoma》。源站首次发布:Oct 28 201。
【数据内容】
源站原始描述:Purpose: We report the coding and non-coding transcriptomic changes in primary cutaneous squamous cell carcinoma
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL18573、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139505
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 09 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139505
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含9例原发性皮肤鳞状细胞癌和7例健康皮肤样本的全转录组测序数据,用于差异表达和非编码RNA分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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