孤立性纤维性肿瘤全外显子测序数据
包含17对孤立性纤维性肿瘤及匹配正常样本的外显子测序数据，用于突变和基因组特征分析。由dbGaP / SIGMA提供，来自dbGaP，数据格式为表格，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
孤立性纤维性肿瘤全外显子测序数据
【一句话概览】
孤立性纤维瘤是罕见的间充质肿瘤，可为良性或恶性。本研究对17对孤立性纤维瘤肿瘤与正常样本进行了外显子组测序和分析，采用Illumina HiSeq 2000平台的全外显子测序技术。该研究属于美洲基因组医学Slim计划（SIGMA）中癌症特征描述大型工作的一部分（来源 NCBI）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic Sequencing of Solitary Fibrous Tumors》。
【数据内容】
源站原始描述：Solitary fibrous tumors (SFTs) are rare mesenchymal tumors that can be benign or malignant. In this study, we sequenced and analyzed the exomes of 17 SFT matched tumor and normal pairs. This study appertains to a large endeavor to characterize cancers as part of the Slim Initiative for Genomic Medicine in the Americas (SIGMA) project
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：孤立性纤维性肿瘤（SFTs）是一种罕见的间叶组织肿瘤，可为良性或恶性。本研究对17对SFT肿瘤与正常组织配对样本进行了外显子组测序与分析。本研究隶属于旨在描绘癌症特征的大型项目——美洲基因组医学精简计划（SIGMA）的一部分。
【主题与分类】
主题标签：Solitary Fibrous Tumors、Sarcoma、mesenchymal tumors、Whole Exome Sequencing、Illumina HiSeq 2000。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000568.v1.p1
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000568.v1.p1
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含17对孤立性纤维性肿瘤及匹配正常样本的外显子测序数据，用于突变和基因组特征分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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