亚型特异性基因组改变定义软组织肉瘤治疗新靶点
软组织肉瘤亚型特异性基因组改变数据集，用于发现新治疗靶点。
基本信息
资源简介
亚型特异性基因组改变定义软组织肉瘤治疗新靶点
【一句话概览】
该 SuperSeries 由两个子系列组成：GSE21122 提供软组织肉瘤肿瘤与对照正常脂肪标本的全转录本表达数据，GSE21123 提供软组织肉瘤样本的 Affymetrix SNP 阵列数据，可参考各子系列。相关标签包括 array 比较基因组杂交、array 转录谱分析，物种为 Homo sapiens。标题表明亚型特异性基因组改变为软组织肉瘤治疗定义新靶点（来源 BioStudies）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Subtype-specific genomic alterations define new targets for soft tissue sarcoma therapy》。
【数据内容】
源站原始描述：This SuperSeries is composed of the following subset Series: GSE21122: Whole-transcript expression data for soft-tissue sarcoma tumors and control normal fat specimens GSE21123: Affymetrix SNP array data for soft tissue sarcoma samples Refer to individual Series
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：本 SuperSeries 由以下子系列组成：GSE21122：软组织肉瘤肿瘤和对照正常脂肪标本的全转录本表达数据；GSE21123：软组织肉瘤样本的 Affymetrix SNP 芯片数据。请参阅各个系列。
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-21124
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-21124
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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