软组织肉瘤蛋白质组图谱

包含321例软组织肉瘤患者、11种组织学亚型FFPE肿瘤样本的蛋白质组数据,用于分子分型和预后研究。由Institute of Cancer Research提供,来自ProteomeXchange,数据格式为表格,适用于分类任务。

Institute of Cancer ResearchInstitute of Cancer Research
ProteomeXchange
2024-10-03 更新
浏览 19
表格分类SarcomaTMTMSHomo sapiens (Human)9606
PXD036226

基本信息

模态
表格
数据量
321
任务类型
分类
创建/更新时间
2024-10-03

资源简介

软组织肉瘤蛋白质组图谱

【一句话概览】

该研究针对罕见且类型多样的间叶源性肿瘤——软组织肉瘤(STS),其治疗选择有限。研究者对321例STS患者的福尔马林固定石蜡包埋肿瘤标本进行了全面的蛋白质组学分析,这些患者涵盖11种组织学亚型。相关数据涉及60个文件,采用TMT和质谱(MS)技术,物种为智人(Homo sapiens,9606)(来源 ProteomeXchange)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《The Proteomic Landscape of Soft Tissue Sarcomas》。

【数据内容】

源站原始描述:Soft tissue sarcomas (STS) are rare and diverse mesenchymal cancers with limited treatment options. Here we undertake comprehensive proteomic profiling of formalin-fixed paraffin embedded tumour specimens from 321 STS patients representing 11 histological subtypes

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):软组织肉瘤(STS)是一类罕见且异质性强的间叶组织来源恶性肿瘤,治疗选择有限。本研究对来自321例STS患者、涵盖11种组织学亚型的福尔马林固定石蜡包埋肿瘤标本进行了全面的蛋白质组学分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 60 个。

【主题与分类】

主题标签:Sarcoma, TMT, MS、Homo sapiens (Human)、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://proteomecentral.proteomexchange.org/dataset/PXD036226

规范引用:37386008

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含321例软组织肉瘤患者、11种组织学亚型FFPE肿瘤样本的蛋白质组数据,用于分子分型和预后研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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