FET重排软组织肌上皮肿瘤甲基化数据
包含FET重排软组织肌上皮肿瘤DNA甲基化谱数据,用于软组织肿瘤表观遗传分型和分子诊断研究。由Memorial Sloan Kettering Cancer Center提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含52条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的软组织肉瘤研究。

基本信息
资源简介
FET重排软组织肌上皮肿瘤甲基化数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《FET-Rearranged Soft Tissue Myoepithelial Tumors Span a Broad Clinicopathologic and Molecular Spectrum that is Epigenetically Distinct from Cutaneous and Head and Neck Myoepithelial Tumors》。源站首次发布:Jun 18 202。
【数据内容】
源站原始描述:DNA methylation profiling from a multi-institutional cohort of 52 fusion-positive MET cases were analyzed. Pooled clinicopathological and outcome analysis with new and published cases (total 185 and 69 cases, respectively) was performed. The MET subgroups, EWSR1::KLF15, EWSR1/FUS::KLF17, EWSR1::PBX1, EWSR1::PBX3, EWSR1/FUS::POU5F1, SS18::POU5F1, and EWSR1::ZNF444, showed significant heterogeneity in age group, site, and histology. DNA methylation analysis revealed that fusion-positive MET were e…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Methylation profiling by genome tiling array、GPL33022、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300102
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 12 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300102
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含FET重排软组织肌上皮肿瘤DNA甲基化谱数据,用于软组织肿瘤表观遗传分型和分子诊断研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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