软组织肉瘤转录组分类数据
该数据集整合了来自TCGA-SARC、CINSARC及内部队列的软组织肉瘤转录组(基因表达)和临床(表格)数据,包含RNA-Seq和靶向测序生成的基因表达计数、患者临床信息及预后预测结果,主要用于癌症分子分型、预后亚型识别和治疗策略研究,支持机器学习分析和精准医疗应用。
https://figshare.com/articles/dataset/Data_for_Machine_learning-based_analysis_of_genomic_and_transcriptomic_data_unveils_sarcoma_clusters_with_superlative_prognostic_and_predictive_value/27948597/2
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资源简介
该数据集整合了来自多个来源的转录组和临床数据,用于软组织肉瘤的预后亚型分类和治疗策略识别。数据主要包括:1)TCGA-SARC队列的RNA-Seq基因表达数据和临床信息,用于外部验证、差异表达和生存分析;2)CINSARC数据集的基因表达和临床数据,用于验证预后基因特征和跨队列亚型可重复性;3)内部研究队列(82名软组织肉瘤患者)的转录组和临床数据,包括通过FoundationOne RNA和FoundationOne CDx平台生成的原始基因表达计数、临床注释(如组织学、治疗和结局)以及使用Sarculator工具计算的预后预测结果。该数据集主要应用于癌症分子分型、预后预测和精准治疗策略研究。
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