软组织肉瘤转录组分类数据
该数据集整合了来自TCGA-SARC、CINSARC及内部队列的软组织肉瘤转录组（基因表达）和临床（表格）数据，包含RNA-Seq和靶向测序生成的基因表达计数、患者临床信息及预后预测结果，主要用于癌症分子分型、预后亚型识别和治疗策略研究，支持机器学习分析和精准医疗应用。
基本信息
资源简介
软组织肉瘤转录组分类数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Data for Transcriptomic-based classification identifies prognostic subtypes and therapeutic strategies in soft tissue sarcomas》。源站首次发布：2025-05-01。
【数据内容】
源站原始描述：Data Sources and Descriptions This study integrates transcriptomic and clinical data from three main sources to classify prognostic subtypes and identify therapeutic strategies in soft tissue sarcomas (STS): 1. TCGA-SARC Cohort - Source: Genomic Data Commons (GDC) Portal - Content: RNA-Seq gene expression data and associated clinical information from The Cancer Genome Atlas Sarcoma Project (TCGA-SARC). - Purpose: Serves as an external validation cohort for subtype comparisons, differential expre…
主表 clinical_cinsarc_paper.csv 含 17 列、样本前 207 行结构完整。
主表 TCGA-TC-Classified.csv 含 13 列、样本前 128 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个，合计 29.98 MB。clinical_cinsarc_paper.csv：text/csv，33.37 KB。TCGA-TC-Classified.csv：text/csv，27.19 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.27948597.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genetics not elsewhere classified。主题标签：Soft Tissue Sarcoma Sarcomas。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genetics not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Data_for_Machine_learning-based_analysis_of_genomic_and_transcriptomic_data_unveils_sarcoma_clusters_with_superlative_prognostic_and_predictive_value/27948597
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Sokolov Ravasqueira, Manuel (2025). Data for Transcriptomic-based classification identifies prognostic subtypes and therapeutic strategies in soft tissue sarcomas. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集整合了来自多个来源的转录组和临床数据，用于软组织肉瘤的预后亚型分类和治疗策略识别。数据主要包括：1）TCGA-SARC队列的RNA-Seq基因表达数据和临床信息，用于外部验证、差异表达和生存分析；2）CINSARC数据集的基因表达和临床数据，用于验证预后基因特征和跨队列亚型可重复性；3）内部研究队列（82名软组织肉瘤患者）的转录组和临床数据，包括通过FoundationOne RNA和FoundationOne CDx平台生成的原始基因表达计数、临床注释（如组织学、治疗和结局）以及使用Sarculator工具计算的预后预测结果。该数据集主要应用于癌症分子分型、预后预测和精准治疗策略研究。
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