CLL淋巴结与外周血RNA测序数据集
包含CLL患者外周血CD19+细胞、淋巴结CD19+细胞及淋巴结活检RNA-seq数据。由National Institutes of Health提供,来自GEO,数据格式为表格,包含101条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的小淋巴细胞淋巴瘤研究。

基本信息
资源简介
CLL淋巴结与外周血RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Interdependencies of Intratumoral Genetic Heterogeneity and the Immune Microenvironment in Chronic Lymphocytic Leukemia (Bulk RNA)》。源站首次发布:Nov 18 202。
【数据内容】
源站原始描述:The tumor microenvironment (TME) and somatic mutations drive progression of chronic lymphocytic leukemia (CLL). Integrated bulk and single-cell RNA sequencing (RNA-seq) of paired peripheral blood (PB) and lymph node (LN) samples from patients with treatment naïve CLL showed upregulation of oncogenic processes in LN attributable to a minor population of activated tumor cells. A 10-gene activated tumor signature was positively correlated with activated CD4+ T cells and M2 macrophages in the TME. W…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL11154、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE161711
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 17 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE161711
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含CLL患者外周血CD19+细胞、淋巴结CD19+细胞及淋巴结活检RNA-seq数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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