与人皮肤原发性黑色素瘤远处无转移生存相关的转录组分析队列

该数据集来自 omicsdi.org,为一批人皮肤原发性黑色素瘤的转录组分析数据,关联远处无转移生存信息。数据覆盖肿瘤/皮肤癌方向,主题标签为 Transcriptomics

omicsdi
浏览 5
基因组预测Transcriptomics
Transcription profiling of cohort of human cutaneous primary melanomas associated with a distant metastasis free survival

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

与人皮肤原发性黑色素瘤远处无转移生存相关的转录组分析队列

该数据集为一批人皮肤原发性黑色素瘤的转录组分析数据,关联远处无转移生存(distant metastasis free survival)信息,旨在识别人皮肤原发性黑色素瘤中与远处无转移生存相关的基因组特征。数据集英文名称为“Transcription profiling of cohort of human cutaneous primary melanomas associated with a distant metastasis free survival”,在分类上归属于肿瘤/皮肤癌方向,主题标签为 Transcriptomics,来源站为 omicsdi.org。整体而言,该数据集以转录组层面的表达谱信息为核心,将原发性皮肤黑色素瘤样本与临床随访中的远处转移结局相联系,为研究黑色素瘤转移相关的分子特征提供了数据基础。

【数据集背景】

皮肤黑色素瘤是起源于皮肤黑色素细胞的恶性肿瘤,其远处转移的发生与患者预后密切相关。识别能够提示远处转移风险的原发性肿瘤分子特征,是黑色素瘤研究中的重要方向。该数据集正是围绕这一背景构建:通过对一批人皮肤原发性黑色素瘤样本进行转录组分析,并将分子数据与远处无转移生存信息相关联,用于探索与远处转移风险相关的基因组特征。源站描述指出,其目标在于识别该人皮肤原发性黑色素瘤队列中与远处无转移生存相关的基因组特征。

【数据内容】

该数据集的核心内容为人皮肤原发性黑色素瘤的转录组分析数据,主题标签为 Transcriptomics,属于肿瘤/皮肤癌方向。数据所覆盖的样本为一批人皮肤原发性黑色素瘤,并关联有远处无转移生存信息,即样本对应的远处转移相关生存结局。除上述内容外,数据集所包含的具体样本数量、基因或转录本数量、表达定量方式、临床变量字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述表明,其数据来自对人皮肤原发性黑色素瘤队列的转录组分析,用于识别与远处无转移生存相关的基因组特征。关于样本采集地点、采集时间、随访方案、测序或芯片平台等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容,该数据集适用于与皮肤黑色素瘤转移相关的转录组研究场景,例如:探索原发性黑色素瘤中与远处无转移生存相关的表达特征;开展生存相关的分子标志物筛选与验证研究;作为黑色素瘤转录组分析的方法学参考数据;以及与其他黑色素瘤转录组数据进行比较分析等。具体适用场景应结合数据实际内容判断,源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

该数据集以转录组分析数据形式提供,使用时可结合其关联的远处无转移生存信息开展表达谱与生存结局的关联分析。关于数据的具体下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法及分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为特定人皮肤原发性黑色素瘤队列的转录组数据,其结果的外推需考虑队列构成与样本规模等因素。关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应、随访完整性等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。关于数据集的引用方式、原始发表文献、许可协议及使用限制等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-TABM-1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Identification of genomic characteristics in a cohorte of human cutaneous primary melanoma associated with a distant metastasis free survival.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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