质谱成像皮肤肿瘤生物标志物数据集

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦皮肤肿瘤的质谱成像(MSI)研究,覆盖皮肤癌、鳞状细胞癌(SCC)、基底细胞癌(BCC)及非黑色素瘤皮肤癌(NMSC)

Bispebjerg HospitalBispebjerg Hospital
clinicaltrials
浏览 11
医学影像分类Skin CancerSquamous Cell CarcinomaBasal Cell CarcinomaNon-melanoma Skin Cancer
Skin Tumor Biomarkers by Mass Spectrometry Imaging

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

质谱成像皮肤肿瘤生物标志物数据集

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦皮肤肿瘤的质谱成像(MSI)研究,覆盖皮肤癌、鳞状细胞癌(SCC)、基底细胞癌(BCC)及非黑色素瘤皮肤癌(NMSC)。研究旨在利用 MSI 在离体条件下定位 BCC 与 SCC 的微小聚集灶,并依据脂质模式等化学特征将其与邻近正常皮肤区分,而不依赖组织病理学特征的视觉识别。数据可用于皮肤肿瘤检测与生物标志物发现相关研究(来源 clinicaltrials.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Conditions: Skin Cancer, Squamous Cell Carcinoma, Basal Cell Carcinoma, Non-melanoma Skin Cancer. 1. 标题 通过质谱成像研究皮肤肿瘤生物标志物 2. 目的 2.1 问题定义 2018 年全球有超过 100 万患者被诊断为非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),由于缺乏登记或该类型癌症登记不完整,这一数字可能被低估 [1]。及时检测微小肿瘤在癌症诊断中至关重要。我们相信质谱成像(MSI)能够成功定位一种常见皮肤癌——基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC)的微小聚集灶,并在离体条件下将其与邻近正常皮肤区分开来。MSI 可揭示 BCC 和 SCC 区域改变的化学特征(脂质模式),且不依赖组织病理学特征的视觉识别。2.2 假设

【主题与分类】

主题标签:Skin Cancer、Squamous Cell Carcinoma、Basal Cell Carcinoma、Non-melanoma Skin Cancer。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06227416

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

疾病:皮肤癌、鳞状细胞癌、基底细胞癌、非黑色素瘤皮肤癌。1. 标题 通过质谱成像技术研究皮肤肿瘤生物标志物 2. 目的 2.1 问题定义 2018年,全球有超过100万患者被诊断为非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),由于缺乏登记或此类癌症登记不完整,这一数字可能被低估[1]。在癌症诊断中,及时发现微小肿瘤至关重要。我们相信,质谱成像(MSI)能够成功定位常见皮肤癌——基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC)的微小聚集,并在离体条件下将其与邻近正常皮肤区分开来。MSI揭示了BCC和SCC区域化学特征(脂质模式)的改变,并且不依赖于组织病理学特征的视觉识别。2.2 假设 我们假设,在皮肤活检切片中,NMSC细胞表现出与健康皮肤组织不同的特异性内源性生物标志物(脂质模式)。

如果该假设正确,未来将有可能利用质谱引导手术实现对非黑色素瘤皮肤癌(NMSC)的实时组织诊断与治疗。2.3 结局指标 * 在莫氏手术切除的基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC)组织切片中,鉴定所选脂质生物标志物的质量与分布。 * 在光化性角化病(癌前病变)活检切片中,鉴定所选脂质生物标志物的质量与分布。2.4 背景 根据世界癌症研究基金会2019年发布的《皮肤癌报告》,2018年非黑色素瘤皮肤癌(NMSC)的发病率为每百万人中100万例,被列为全球最常见的癌症[1]。NMSC主要包括基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC)。在丹麦和其他西方国家,这些肿瘤的发生率也很高[2],且丹麦的发病率持续上升,每年达到15,000例。NMSC的主要风险因素是暴露于紫外线辐射(UVR)。浅肤色

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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