黑色素瘤患者anti-LAG3+anti-PD1治疗的单细胞特征
该数据集来自omicsdi.org,收录了转移性黑色素瘤患者接受anti-LAG3+anti-PD1(160+480 mg)治疗后的血液样本单细胞数据

基本信息
资源简介
黑色素瘤患者anti-LAG3+anti-PD1治疗的单细胞特征
该数据集来自omicsdi.org,收录了转移性黑色素瘤患者接受anti-LAG3+anti-PD1(160+480 mg)治疗后的血液样本单细胞数据。研究对6例患者的样本进行scRNA+TCRαβ-seq(10X 5')测序,并结合来自40例更大队列的多组学分析(流式、细胞因子、TCRb-seq)。数据涵盖基线、1个月和3个月三个时间点,分选标记为CD45+。该数据可用于研究免疫治疗下黑色素瘤患者外周血免疫细胞的转录组与T细胞受体特征,支持疗效相关细胞亚群及动态变化的探索(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们评估了6例转移性黑色素瘤患者的血液样本,这些患者在一项I期试验(NCT01968109)中接受了anti-LAG3+anti-PD1(160+480 mg)治疗,使用单细胞RNA和T细胞受体(TCR)测序(scRNA+TCRαβ-seq,10X 5'),并结合来自40例患者更大队列的其他多组学分析(流式、细胞因子、TCRb-seq)。该数据集包括三个时间点,包括基线、1个月和3个月。分选为CD45+。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12733
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12733
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们评估了来自一项I期试验(NCT01968109)中6名接受抗LAG3+抗PD1(160+480 mg)治疗的转移性黑色素瘤患者的血液样本,采用单细胞RNA和T细胞受体(TCR)测序(scRNA+TCRαβ-seq,10X 5’)结合来自更大队列40名患者的其他多组学分析(流式、细胞因子、TCRb-seq)。该数据集包括三个时间点,即基线、1个月和3个月。分选为CD45+。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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