SIAH3在癌症中频繁表观遗传沉默并调控线粒体代谢——表达蛋白质组学数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000093851

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在人类基因组中，已鉴定出七个缺失同源物（SIAH）家族中的三个成员。与编码E3泛素连接酶的SIAH1和SIAH2不同，关于SIAH3在肿瘤发生中的调控与功能知之甚少。本研究揭示，SIAH3在不同类型的癌症中频繁遭遇表观遗传沉默，包括皮肤黑色素瘤、肺腺癌及头颈癌。SIAH3水平低下与癌症患者生存率受损相关联。此外，诱导SIAH3表达可减少细胞增殖。在功能上，SIAH3通过促使细胞从有氧氧化磷酸化转向糖酵解，对细胞代谢产生负面影响。SIAH3定位于线粒体，并与参与线粒体核糖体生物生成和翻译的蛋白质相互作用。我们还报告，SIAH3与泛素连接酶（包括SIAH1或SIAH2）相互作用，并被它们降解。这些结果表明，SIAH3通过抑制氧化磷酸化来调节细胞代谢，从而作为一种受表观遗传控制的肿瘤抑制因子发挥作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。