phs001550:黑色素瘤的遗传与转录组演化
数据围绕黑色素瘤的遗传与转录组演化,包含肿瘤样本及与匹配正常组织的对比信息,可用于研究黑色素瘤在遗传和转录层面的变化特征,并支持肿瘤与匹配正常组织之间的分类或差异分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
phs001550:黑色素瘤的遗传与转录组演化
phs001550: The Genetic and Transcriptomic Evolution of Melanoma 是一个聚焦于黑色素瘤遗传与转录组演化的数据集,属于肿瘤 / 皮肤癌类别,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集围绕黑色素瘤在遗传和转录层面的变化特征展开,包含肿瘤样本以及与匹配正常组织之间的对比信息。其主题标签为 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal,表明数据设计支持肿瘤与匹配正常组织之间的分类或差异分析。整体而言,该数据集可用于探索黑色素瘤在遗传与转录组两个层面的演化规律,并为相关研究提供肿瘤与匹配正常组织对照的数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究,主题为肿瘤以及肿瘤与匹配正常组织的对比。其英文名称为 phs001550: The Genetic and Transcriptomic Evolution of Melanoma,表明研究关注黑色素瘤的遗传与转录组演化。本站将其归类为肿瘤 / 皮肤癌,说明其应用领域集中在肿瘤学中的皮肤癌方向。数据集的主题标签为 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal,进一步明确了其核心比较对象是肿瘤样本与匹配正常组织。整体背景指向黑色素瘤在遗传和转录层面的变化特征研究。
【数据内容】
数据围绕黑色素瘤的遗传与转录组演化,包含肿瘤样本及与匹配正常组织的对比信息。主题标签为 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal,说明数据内容涉及肿瘤样本与匹配正常组织之间的配对或对照关系。可用于研究黑色素瘤在遗传和转录层面的变化特征,并支持肿瘤与匹配正常组织之间的分类或差异分析。关于具体的样本数量、测序平台、基因列表、变异位点、表达矩阵维度等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。源站描述为 dbGaP study (Tumor, Tumor vs. Matched-Normal)。主题标签包括 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal。关于采集时间、采集地点、纳入排除标准、样本处理流程、测序深度、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究黑色素瘤在遗传和转录层面的变化特征,并支持肿瘤与匹配正常组织之间的分类或差异分析。其主题标签 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal 表明,该数据可用于肿瘤与匹配正常组织的对照研究,例如识别肿瘤与正常组织之间的遗传或转录差异。本站分类为肿瘤 / 皮肤癌,说明其可服务于皮肤癌尤其是黑色素瘤相关的研究场景。关于具体的分析模型、验证队列、临床终点等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究,主题为 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal。使用时应围绕肿瘤样本与匹配正常组织的对比信息展开,可用于研究黑色素瘤的遗传与转录组演化,并支持肿瘤与匹配正常组织之间的分类或差异分析。关于数据下载方式、访问权限申请流程、数据处理步骤、软件工具推荐等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究,主题标签为 Tumor、Tumor vs. Matched-Normal。关于样本量、数据完整性、批次效应、测序质量、缺失值比例、验证程度等质量指标,源站未提供。关于使用限制、隐私保护、数据共享约束等,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集英文名称为 phs001550: The Genetic and Transcriptomic Evolution of Melanoma,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。关于具体的引用格式、许可条款、使用协议、访问权限及授权要求等,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001550
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Tumor, Tumor vs. Matched-Normal).
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