转移性黑色素瘤的克隆结构与驱动突变

数据聚焦转移性黑色素瘤,涉及克隆结构与驱动突变,可用于研究肿瘤克隆演化与驱动基因变异。源站描述仅标注为 dbGaP study (Case Set),未提供样本量、测序平台、数据类型等更多细节(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
浏览 6
基因组分类Case Set
phs001241: Clonal Architectures and Driver Mutations in Metastatic Melanomas

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

转移性黑色素瘤的克隆结构与驱动突变

该数据集英文名为 phs001241: Clonal Architectures and Driver Mutations in Metastatic Melanomas,属于肿瘤领域中皮肤癌方向的研究资源,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。根据源站描述,该资源为 dbGaP study (Case Set),主题标签为 Case Set。其侧写线索表明,数据聚焦于转移性黑色素瘤,涉及克隆结构与驱动突变,可用于研究肿瘤克隆演化与驱动基因变异。需要说明的是,源站描述仅标注为 dbGaP study (Case Set),未提供样本量、测序平台、数据类型等更多细节,因此本介绍在相应部分将如实标注“源站未提供”,不对缺失信息作任何推测。

【数据集背景】

该数据集以转移性黑色素瘤为研究对象。黑色素瘤是一种来源于黑色素细胞的恶性肿瘤,转移性黑色素瘤通常意味着肿瘤已从原发部位扩散至其他组织或器官,其基因组往往具有较高的突变负荷和复杂的克隆结构。数据集名称中同时出现“克隆结构”与“驱动突变”,提示其研究关注点在于肿瘤细胞群体在演化过程中形成的克隆组成,以及推动肿瘤发生发展的关键基因变异。该资源被归类于肿瘤 / 皮肤癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述标注为 dbGaP study (Case Set),主题标签为 Case Set。关于该研究的具体立项背景、研究机构、研究目的等更详细的信息,源站未提供。

【数据内容】

从名称与侧写线索来看,该数据集的内容围绕转移性黑色素瘤的克隆结构与驱动突变展开,可用于研究肿瘤克隆演化与驱动基因变异。主题标签为 Case Set,表明其属于病例集合性质的数据资源。然而,关于数据的具体内容构成,例如包含哪些类型的组学数据、是否包含体细胞突变列表、拷贝数变异、克隆频率或系统发育结构等信息,源站未提供。样本量、测序平台、数据类型等细节同样未在源站描述中给出。因此,无法进一步说明该数据集所包含的具体字段、文件格式或数据层级。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为 dbGaP study (Case Set)。dbGaP 是 NCBI 维护的基因型与表型数据库,通常用于存储与共享人类遗传学研究数据。该资源以 Case Set 形式组织,主题标签亦为 Case Set。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息、病例的具体临床特征等,源站未提供。数据的具体提交者、所属研究项目以及原始研究论文等信息,源站描述中亦未体现。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于转移性黑色素瘤相关的肿瘤克隆演化研究与驱动基因变异研究。研究人员可将其用于探索肿瘤细胞群体中克隆结构的组成与变化,以及识别或验证与转移性黑色素瘤相关的驱动突变。由于主题标签为 Case Set,该资源也可能用于病例对照或病例集合框架下的遗传关联分析。但需要强调的是,由于源站未提供样本量、测序平台与数据类型等关键细节,实际可开展的分析类型与分析范围需以获取数据后的实际情况为准,本介绍不对具体分析方案作任何推断。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究条目,通常此类数据需通过 dbGaP 的受控访问流程申请获取。但关于该数据集的具体访问方式、申请条件、下载途径、所需工具或分析流程,源站未提供。因此,无法在本介绍中给出具体的使用步骤或操作建议。

【质量与限制】

该数据集被标注为 dbGaP study (Case Set),来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据质量评估指标、缺失率、批次效应、覆盖度、验证情况等信息,源站未提供。其限制在于,源站描述仅标注为 dbGaP study (Case Set),未提供样本量、测序平台、数据类型等更多细节,这使得对该数据集的适用范围与可靠性进行完整评估存在困难。使用者应在获取数据后自行核查相关质量信息。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享协议,源站未提供。由于该资源来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究条目,通常涉及受控访问与数据使用协议,但具体条款需以源站或数据提供方的正式说明为准,本介绍不作推测。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001241

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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