IDR idr0109-zaritsky-melanoma 黑色素瘤实验A
主题标签:肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、细胞成像、组织成像、IDR。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的医学影像公开数据集,来源:idr,主题涵盖肿瘤。

基本信息
资源简介
IDR idr0109-zaritsky-melanoma 黑色素瘤实验A
IDR idr0109-zaritsky-melanoma(experimentA)是一个面向肿瘤与皮肤癌研究领域的公开细胞与组织成像数据集,收录于 Image Data Resource(IDR)平台,该平台由 OME 与 EMBL-EBI 维护,提供经过策展的细胞与组织成像研究数据。该数据集属于黑色素瘤相关研究,共包含 21 幅图像,主题标签涵盖肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、细胞成像与组织成像。作为 IDR 中的一项策展研究,它面向肿瘤学与皮肤癌方向的科研人员,提供可公开访问的显微成像资源,便于围绕黑色素瘤的细胞与组织形态开展观察与比较。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
该数据集的主题属于肿瘤学中的皮肤癌方向,具体聚焦黑色素瘤。黑色素瘤是皮肤癌中备受关注的一类肿瘤,相关研究通常涉及细胞形态、组织结构和显微成像观察。该数据集以细胞成像与组织成像为主要内容形式,归入肿瘤 / 皮肤癌分类,服务于公开科研数据共享的定位。其英文名称中的 idr0109-zaritsky-melanoma 表明它是 IDR 平台上一项以研究者命名的黑色素瘤研究,experimentA 表示该研究下的一个实验分组。IDR 作为策展型细胞与组织成像研究资源,为该数据集提供了公开访问与长期保存的基础。
【数据内容】
该数据集共包含 21 幅图像,内容属于细胞成像与组织成像范畴,主题围绕黑色素瘤相关的肿瘤研究。图像以显微成像形式呈现,可用于观察细胞与组织的形态特征。数据集的主题标签包括肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、细胞成像、组织成像与 IDR,这些标签概括了其内容范围。除图像数量与主题标签外,关于图像的具体模态、通道设置、分辨率、样本类型细分、实验条件与分组设计等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 平台。源站将其描述为 IDR 研究 idr0109-zaritsky-melanoma 的实验 experimentA,属于经过策展的细胞与组织成像研究,由 OME 与 EMBL-EBI 提供支持。数据集的原始实验采集设备、成像参数、样本制备方法、采集时间与地点等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤与皮肤癌领域的成像相关研究与教学场景,尤其是围绕黑色素瘤的细胞与组织形态观察。研究人员可将其用于显微图像的浏览、形态学比较以及成像分析方法的演示与验证。由于其属于公开的策展成像研究资源,也可作为数据共享与复用实践的参考材料。关于该数据集是否适用于特定的定量分析、机器学习训练或临床相关研究,源站未提供相应说明。
【使用方法】
该数据集可通过 idr.openmicroscopy.org 访问,属于 IDR 平台上的公开研究资源。用户可在 IDR 中浏览该研究及其实验 experimentA 下的图像。关于具体的下载方式、文件格式、图像查看工具、API 访问途径以及使用限制等技术细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 IDR 平台上的策展细胞与组织成像研究,具备公开可访问与主题明确的特点,图像数量为 21 幅。其限制在于,关于图像的分辨率、成像质量评估、样本量构成、实验重复情况以及潜在的批次效应等信息,源站未提供。因此,在将其用于定量比较或结论性分析前,需结合源站进一步核实相关技术细节。
【引用与许可】
该数据集来自 Image Data Resource(idr.openmicroscopy.org),源站描述中提及其为 OME 与 EMBL-EBI 相关的策展成像研究资源。关于该数据集的具体引用格式、作者列表、发表文献以及许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-1801
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDR study idr0109-zaritsky-melanoma. Experiment: experimentA. Images: 21. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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