IDC TCGA-SKCM 皮肤黑色素瘤数据集

数据集获取

源站：https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=tcga_skcm

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDC 收集 TCGA-SKCM。癌症类型：皮肤黑色素瘤。肿瘤位置：皮肤。受试者：470 例。黑色素瘤是一种发生在称为黑素细胞的皮肤细胞中的癌症。黑素细胞是产生黑色素的细胞，黑色素赋予皮肤颜色。当暴露于阳光下时，这些细胞会产生更多的黑色素，导致皮肤变黑或晒黑。黑色素瘤可发生在身体的任何部位，风险因素包括肤色白皙、黑色素瘤家族史以及长期暴露于自然或人造阳光下。黑色素瘤最常被发现是因为它已转移或扩散到另一个器官，例如淋巴结。在许多情况下，原发性皮肤黑色素瘤部位从未被发现。由于这一挑战，TCGA 主要研究转移性病例（与其他被选中研究的癌症不同，其他癌症排除转移性病例）。2011 年，估计有 70,230 例黑色素瘤新发病例和 8,790 例死于该疾病。请参阅 TCGA-SKCM 收集的 DICOM 转换幻灯片显微镜图像（https://doi.org/10.5281/zenodo.12690039）页面，以了解有关组织病理学图像的更多信息，并获取该收集的任何支持性元数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。