Salubrinal处理的501mel黑色素瘤细胞基因表达
该数据集来自NCBI GEO,收录Salubrinal处理的501mel黑色素瘤细胞基因表达数据,与DMSO对照比较,观察Salubrinal对基因表达随时间变化的影响

基本信息
资源简介
Salubrinal处理的501mel黑色素瘤细胞基因表达
Gene expression in 501mel melanoma cells treated with Salubrinal.
该数据集来自NCBI GEO,收录Salubrinal处理的501mel黑色素瘤细胞基因表达数据,与DMSO对照比较,观察Salubrinal对基因表达随时间变化的影响。Salubrinal抑制eIF2-alpha磷酸酶,增加eIF2-alpha磷酸化并抑制eIF2B翻译起始因子,从而重编程翻译。数据仅含1个文件GSE86806_series_matrix.txt.gz,基于GPL10558表达谱芯片平台,物种为人(9606)。结果可用于生成与侵袭性相关的基因表达特征,以及先天抗PD-1治疗抵抗特征,适用于肿瘤侵袭与免疫治疗抵抗相关研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 12 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症死亡的主要原因是转移。虽然研究已鉴定出多种驱动侵袭性的信号,但作为转移定植的第一步,细胞离开原发肿瘤的原因仍不太清楚。Salubrinal抑制一种eIF2-alpha磷酸酶,从而导致eIF2-alpha磷酸化增加并抑制eIF2B翻译起始因子,进而重编程翻译。本数据集考察了Salubrinal对501mel黑色素瘤细胞系基因表达随时间变化的影响,并与DMSO处理的对照细胞进行比较。结果被用于生成与侵袭性相关的基因表达特征,以及“先天抗PD-1治疗抵抗特征”。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86806
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86806
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
癌症死亡的主要原因在于转移。尽管研究已识别出多种驱动侵袭性的信号,但作为转移定植的第一步,细胞离开原发肿瘤的原因仍不甚明了。Salubrinal抑制eIF2-α磷酸酶,从而导致eIF2-α磷酸化增加及eIF2B翻译起始因子受抑,进而引发翻译重编程。所呈现的数据集探究了Salubrinal对501mel黑色素瘤细胞系基因表达随时间的影响,并与对照组DMSO处理的细胞进行了比较。这些结果被用于生成一个与侵袭性相关的基因表达特征,以及“先天性抗PD-1治疗抵抗特征”。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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