IGR37黑色素瘤细胞在DMEM或转至MEM后的基因表达
该数据集来自NCBI,收录IGR37黑色素瘤细胞在营养丰富的DMEM培养基中生长以及转至MEM培养基后的基因表达谱,采用表达谱芯片检测,仅含1个文件(GSE77655_series_matrix.txt.gz)

基本信息
资源简介
IGR37黑色素瘤细胞在DMEM或转至MEM后的基因表达
Gene expression in IGR37 melanoma cells grown in DMEM or after transfer to MEM
该数据集来自NCBI,收录IGR37黑色素瘤细胞在营养丰富的DMEM培养基中生长以及转至MEM培养基后的基因表达谱,采用表达谱芯片检测,仅含1个文件(GSE77655_series_matrix.txt.gz)。研究通过比较不同培养条件下的基因表达差异,生成与人类黑色素瘤去分化、侵袭性和耐药性相关的基因表达特征,可用于探索培养条件对黑色素瘤细胞基因表达的影响及转移相关机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 08 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症死亡的主要原因在于转移。虽然研究已鉴定出多种驱动侵袭性的信号,但作为转移定植的第一步,细胞离开原发肿瘤的原因仍不太清楚。此处呈现的数据集通过比较黑色素瘤细胞系在营养丰富的DMEM与MEM中的表达,考察不同培养条件对基因表达的影响。结果被用于生成一种基因表达特征,该特征在人类黑色素瘤中与去分化、侵袭性和耐药性相关。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE77655
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
癌症死亡的主要原因在于转移。尽管研究已识别出多种驱动侵袭性的信号,但转移定植的第一步——细胞离开原发肿瘤的原因,仍不甚明了。本文所呈现的数据集通过比较黑色素瘤细胞系在营养丰富的DMEM与MEM中的表达,探究了不同培养条件对基因表达的影响。这些结果被用于生成一个基因表达特征,该特征在人类黑色素瘤中与去分化、侵袭性和耐药性相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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