光化性角化病进展为皮肤鳞状细胞癌涉及miR-204沉默与STAT3激活转换

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE71953

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

鳞状细胞癌是第二常见的皮肤癌，且常由上皮内的光化性角化病进展而来。微小RNA在光化性角化病向皮肤鳞状细胞癌（cSCC）进展过程中的作用仍有待阐明。通过使用Agilent微小RNA表达芯片，我们发现与光化性角化病相比，cSCC中miR-204的表达显著下调。miR-204-5p上游TRPM3启动子区域的DNA甲基化被确定为导致cSCC中miR-204沉默的抑制机制之一。对HaCaT细胞的功能研究表明，该微小RNA下调信号转导与转录激活因子3（STAT3）通路并倾向于MAPK信号通路，可能通过PTPN11发挥作用，PTPN11是一种酪氨酸磷酸酶，也是miR-204的直接靶标。我们发现，通过pY705-STAT3免疫荧光检测到的活化STAT3在AK中滞留于细胞膜和细胞质区室，而cSCC则显示STAT3位于细胞核中。综上所述，我们的数据表明MiR-204可能作为一个“变阻器”，控制着信号向MAPK通路或STAT3通路的传导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。