耐药黑色素瘤细胞系与亲本敏感株的基因和microRNA表达谱(mRNA)
该数据集来自NCBI GEO,包含一株对BRAF抑制剂PLX4032耐药的黑色素瘤细胞系及其亲本敏感细胞系的基因和microRNA表达谱(mRNA部分),用于识别耐药相关的基因-microRNA调控网络改变

基本信息
资源简介
耐药黑色素瘤细胞系与亲本敏感株的基因和microRNA表达谱(mRNA)
Gene and microRNA expression profiling of a melanoma cell line resistant to BRAF inhibitor PLX4032 compared to the parental sensitive counterpart (mRNA)
该数据集来自NCBI GEO,包含一株对BRAF抑制剂PLX4032耐药的黑色素瘤细胞系及其亲本敏感细胞系的基因和microRNA表达谱(mRNA部分),用于识别耐药相关的基因-microRNA调控网络改变。研究显示CCL2作为自分泌因子通过HIF1协调调控miR-34a、miR-100和miR-125b,参与细胞增殖与凋亡;抑制CCL2或这些特定miRNA可恢复对BRAF抑制剂的敏感性。数据可用于耐药机制探索、调控网络分析和潜在治疗靶点筛选(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 13 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为识别改变的基因-microRNA调控网络,对一株对BRAF抑制剂PLX4032耐药的黑色素瘤细胞系及其亲本细胞系生成了基因和microRNA表达谱。结果显示,CCL2作为自分泌因子,通过HIF1协调调控miR-34a、miR-100和miR-125b,这些miRNA参与细胞增殖和凋亡。抑制CCL2及这些特定miRNA可恢复对BRAF抑制剂的敏感性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL13938、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68840
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 03 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
为识别发生改变的基因-microRNA调控网络,研究人员构建了对BRAF抑制剂PLX4032耐药的黑色素瘤细胞系及其亲本细胞系的基因和microRNA表达谱。结果显示,CCL2作为一种自分泌因子,通过HIF1协同调控参与细胞增殖和凋亡的miR-34a、miR-100和miR-125b。抑制CCL2及特定miRNAs可恢复对BRAF抑制剂的敏感性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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