非黑色素瘤皮肤癌基因表达谱分子分类数据集
研究通过比较分析将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型三个亚型,并利用功能富集与通路分析揭示各亚型分子特征。数据可用于皮肤癌分子分型、亚型标志物挖掘及 BCC 与 SCC 分子异质性研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
非黑色素瘤皮肤癌基因表达谱分子分类数据集
Molecular classification of non-melanoma skin cancer by gene expression profiling
该数据集来自 NCBI GEO(GSE53462),包含非黑色素瘤皮肤癌(BCC 与 SCC)及正常皮肤组织的基因表达谱芯片数据,文件为 GSE53462_series_matrix.txt.gz。研究通过比较分析将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型三个亚型,并利用功能富集与通路分析揭示各亚型分子特征。数据可用于皮肤癌分子分型、亚型标志物挖掘及 BCC 与 SCC 分子异质性研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 18 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),包括基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC),是更常见的皮肤癌类型。尽管这些肿瘤具有共同的病理和临床特征,但其分子层面的相似性和异质性尚未被充分阐明。本研究通过对 BCC、SCC 和正常皮肤组织的基因表达谱进行比较分析,将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型 BCC 三个亚型。功能富集和通路分析揭示了各亚型的分子特征。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53462
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),包括基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC),是较为常见的皮肤癌类型。尽管这些肿瘤具有共同的病理和临床特征,但其在分子层面的相似性和异质性尚未得到充分阐明。本研究通过对BCC、SCC及正常皮肤组织的基因表达谱进行比较分析,将BCC分为经典型、SCC样型和正常样型三种亚型。功能富集和通路分析揭示了各亚型的分子特征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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