非黑色素瘤皮肤癌基因表达谱分子分类数据集

研究通过比较分析将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型三个亚型,并利用功能富集与通路分析揭示各亚型分子特征。数据可用于皮肤癌分子分型、亚型标志物挖掘及 BCC 与 SCC 分子异质性研究(来源 NCBI)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL105589606
GSE53462: Molecular classification of non-melanoma skin cancer by gene expression profiling

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

非黑色素瘤皮肤癌基因表达谱分子分类数据集

Molecular classification of non-melanoma skin cancer by gene expression profiling

该数据集来自 NCBI GEO(GSE53462),包含非黑色素瘤皮肤癌(BCC 与 SCC)及正常皮肤组织的基因表达谱芯片数据,文件为 GSE53462_series_matrix.txt.gz。研究通过比较分析将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型三个亚型,并利用功能富集与通路分析揭示各亚型分子特征。数据可用于皮肤癌分子分型、亚型标志物挖掘及 BCC 与 SCC 分子异质性研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 18 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),包括基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC),是更常见的皮肤癌类型。尽管这些肿瘤具有共同的病理和临床特征,但其分子层面的相似性和异质性尚未被充分阐明。本研究通过对 BCC、SCC 和正常皮肤组织的基因表达谱进行比较分析,将 BCC 分为经典型、SCC 样型和正常样型 BCC 三个亚型。功能富集和通路分析揭示了各亚型的分子特征。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53462

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非黑色素瘤皮肤癌(NMSC),包括基底细胞癌(BCC)和鳞状细胞癌(SCC),是较为常见的皮肤癌类型。尽管这些肿瘤具有共同的病理和临床特征,但其在分子层面的相似性和异质性尚未得到充分阐明。本研究通过对BCC、SCC及正常皮肤组织的基因表达谱进行比较分析,将BCC分为经典型、SCC样型和正常样型三种亚型。功能富集和通路分析揭示了各亚型的分子特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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