K14 Snail小鼠干细胞与祖细胞研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48859

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EMT诱导转录因子Snail在不同人类癌症中的表达增强。为研究Snail在上皮癌进展过程中的体内作用，我们使用了皮肤特异性过表达Snail的小鼠模型。Snail转基因小鼠自发形成了不同组织学亚型的皮肤癌，如基底细胞癌、鳞状细胞癌和皮脂腺癌。皮脂腺癌的发生与Blimp-1的直接且完全抑制密切相关，Blimp-1是皮脂细胞稳态的核心调控因子。Snail在角质形成细胞干细胞中的表达显著促进了其增殖，并与激活的FoxM1基因表达特征相关，导致Mts24标记的祖细胞池扩大。此外，表达Snail的原代角质形成细胞表现出存活增加和对基因毒性应激的强抵抗力。在皮肤特异性p53缺失背景下，Snail表达导致自发肿瘤形成加速和转移增强。

我们的数据表明，Snail的体内表达通过促进存活增强、癌症干细胞池扩增并伴有DNA损伤积累、终末分化受阻以及肿瘤起始细胞增殖速率增加，从而导致原位上皮性癌变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。