致癌BRAFV600E重塑黑素细胞转录组并诱导BANCR调控黑色素瘤细胞迁移 [Affymetrix]

资源简介

致癌BRAFV600E重塑黑素细胞转录组并诱导BANCR调控黑色素瘤细胞迁移 [Affymetrix]

Oncogenic BRAFV600E remodels the melanocyte transcriptome and induces BANCR to regulate melanoma cell migration [Affymetrix]

该数据集来自NCBI GEO，采用Affymetrix表达谱芯片，聚焦致癌BRAFV600E对黑素细胞转录组的重塑及其诱导的lncRNA BANCR在黑色素瘤细胞迁移中的调控作用。数据覆盖BRAF突变黑色素瘤皮肤癌与过表达致癌BRAF的黑素细胞，可用于分析BRAF调控的蛋白编码转录本、注释lncRNA及新转录本，并支持BANCR作为复发性上调lncRNA的验证与黑色素瘤迁移机制研究（来源 NCBI）。

【数据集背景】

源站首次发布：Apr 10 201。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：迄今为止，大多数癌症基因组学论文都聚焦于基因组DNA和蛋白编码转录本的异常。然而，约50%的转录本没有编码潜力，可能以非编码RNA形式存在。我们对BRAFv600e黑色素瘤皮肤癌以及过表达致癌BRAF的黑素细胞进行了RNA-seq，以编目转录组重塑。我们发现BRAF调控1027个蛋白编码转录本、39个注释lncRNA和70个新转录本的表达。许多新转录本是lncRNA。我们使用一个独立数据集来探究我们的新转录本，发现新lncRNA BANCR是一个受BRAF调控的lncRNA，在黑色素瘤中反复上调。敲低BANCR会损害黑色素瘤细胞迁移。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类：肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37132

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 11 202，引用时请注意版本时效。