机械应力诱导黑色素瘤细胞核膜破裂重组肿瘤-基质相互作用（Stereo-seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE350535

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

外源性机械应力可破坏癌细胞的核膜完整性。然而，该刺激对肿瘤微环境的影响仍不清楚。在此，我们通过构建以下Stereo-seq数据集：(1) 有或无强制跑轮运动条件下后肢足垫移植的B16F10黑色素瘤，以及后肢足垫移植的表达YAP5SA的B16F10黑色素瘤，结果显示成纤维细胞亚型在肿瘤–基质界面附近发生重组织化。(2) 我们使用他莫昔芬诱导的Tyr-CreERT2;Braf^CA;Pten^fl/fl黑色素瘤，在有或无Lmna敲除的条件下，以阐明核膜完整性的作用。Lmna敲除导致肿瘤基质细胞受到扰动。综上所述，这些数据表明外源性机械应力可改变肿瘤微环境的组织方式，而肿瘤细胞核膜完整性的破坏可能是这些变化的基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。