Pannexin 1 缺失破坏细胞周期进程并损害黑色素瘤结构

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348006

标准获取流程：

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数据说明

Pannexin 1（PANX1）是一种形成通道的糖蛋白，已被认为参与调控黑色素瘤细胞特性，如生长、迁移和侵袭。在此我们报告，CRISPR-Cas9介导的PANX1敲除或用丙磺舒抑制通道使A375-P细胞周期分布向G2/M期偏移，而无论PANX1表达如何，用螺内酯抑制通道均使细胞周期进程停滞在G1/S检查点。批量RNA测序显示，采用靶向PANX1的策略后，细胞周期相关基因表达下调，并且当PANX1缺陷细胞用螺内酯处理时，这种下调进一步加剧。当以球状体形式培养时，我们发现PANX1的缺失和抑制破坏了球状体致密化，球状体显示边界不清和圆形度降低。PANX1缺失增加了球状体碎片化，并且当缺乏PANX1的球状体用螺内酯处理时，该表型加剧，提示潜在的合成致死效应。

使用液相色谱-质谱法，我们试图确定 PANX1 是否存在可能稳定球状体完整性的结合伴侣，并发现 PANX1 可与多种细胞黏附分子共免疫沉淀，如 β-肌动蛋白和 F-肌动蛋白加帽蛋白亚基 α-1，提示 PANX1 及其相互作用伴侣可能稳定细胞间接触。当将对照细胞和 PANX1 缺失细胞接种于鸡胚绒毛尿囊膜异种移植模型中以评估其肿瘤生长特征时，我们发现 PANX1 的缺失降低了肿瘤表面积和活力。我们的研究结果表明，PANX1 调控细胞周期进程以及 A375-P 黑色素瘤肿瘤的结构构筑，突显了靶向 PANX1 在黑色素瘤中的治疗价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。