内皮Epac1通过YAP/TAZ调控黑色素瘤生长与血管生成

该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov,研究内皮细胞Epac1在黑色素瘤生长和血管生成中的作用。通过他莫昔芬诱导内皮特异性Epac1/Rapgef3敲除小鼠,皮下接种B16-F10黑色素瘤后,用MACS联合FACS分选肿瘤内皮细胞,提取RNA并进行低起始量RNA测序

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GSE341674: Endothelial Epac1 facilitates YAP/TAZ controlled melanoma growth and angiogenesis

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

内皮Epac1通过YAP/TAZ调控黑色素瘤生长与血管生成

Endothelial Epac1 facilitates YAP/TAZ controlled melanoma growth and angiogenesis

该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov,研究内皮细胞Epac1在黑色素瘤生长和血管生成中的作用。通过他莫昔芬诱导内皮特异性Epac1/Rapgef3敲除小鼠,皮下接种B16-F10黑色素瘤后,用MACS联合FACS分选肿瘤内皮细胞,提取RNA并进行低起始量RNA测序。数据可用于分析内皮Epac1缺失对肿瘤血管生成相关基因表达的影响,探索YAP/TAZ信号通路在其中的调控作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):小鼠通过腹腔注射75 mg/kg BW/day他莫昔芬处理5天,以诱导内皮特异性Epac1/Rapgef3敲除。该敲除使我们能够研究内皮Epac1在皮下接种B16-F10黑色素瘤小鼠肿瘤血管生成中的作用。随后通过MACS加FACS分选从原发性皮下黑色素瘤中分离肿瘤内皮细胞,并用RNAeasy micro kit进行RNA提取。基于RNA模板5′端转换机制(SMART)方法,使用DNBSEQ-G400平台对低起始量样本进行RNA测序。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28457、10090。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE341674

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小鼠连续5天接受75 mg/kg BW/day他莫昔芬腹腔注射,以诱导内皮细胞特异性Epac1/Rapgef3敲除。该敲除模型使我们能够研究内皮Epac1在皮下接种B16-F10黑色素瘤小鼠肿瘤血管生成中的作用。随后,通过MACS联合FACS分选从原发性皮下黑色素瘤中分离肿瘤内皮细胞,并使用RNAeasy micro kit进行RNA提取。低起始量样本的RNA测序基于RNA模板5′端转换机制(SMART)方法,在DNBSEQ-G400平台上进行。

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