SOX10 敲除 A375 黑色素瘤细胞 RNA-seq 表达谱
该数据集为 SOX10 敲除的 A375 黑色素瘤细胞及其匹配对照细胞的 bulk RNA-seq 表达谱,用于研究 SOX10 缺失引起的转录组变化

基本信息
资源简介
SOX10 敲除 A375 黑色素瘤细胞 RNA-seq 表达谱
RNA-seq profiling of SOX10 knockout A375 melanoma cells
该数据集为 SOX10 敲除的 A375 黑色素瘤细胞及其匹配对照细胞的 bulk RNA-seq 表达谱,用于研究 SOX10 缺失引起的转录组变化。SOX10 是调控黑色素细胞身份与黑色素瘤细胞状态的谱系决定转录因子,通过比较敲除与对照样本的基因表达差异,可分析 SOX10 耗竭相关的表达改变,并为研究 SOX10 在黑色素瘤转录程序及细胞状态转换中的作用提供资源。数据包含 1 个文件,主题涉及高通量测序表达谱分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):SOX10 是一种谱系决定转录因子,调控黑色素细胞身份和黑色素瘤细胞状态。为研究 SOX10 缺失的转录后果,我们对 SOX10 敲除的 A375 黑色素瘤细胞及匹配的对照细胞进行了 bulk RNA 测序(RNA-seq)。该数据集可用于分析与 SOX10 耗竭相关的基因表达变化,并为研究 SOX10 在调控黑色素瘤转录程序和细胞状态转换中的作用提供资源。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34295、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319443
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 29 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
SOX10是一种定义谱系的转录因子,调控黑色素细胞身份和黑色素瘤细胞状态。为了探究SOX10缺失的转录后果,我们对SOX10敲除的A375黑色素瘤细胞及匹配的对照细胞进行了bulk RNA测序(RNA-seq)。该数据集使得能够分析与SOX10耗竭相关的基因表达变化,并为研究SOX10在调控黑色素瘤转录程序和细胞状态转换中的作用提供了资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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