A375SM皮肤黑色素瘤细胞PRAME敲低RNA-seq表达谱
该数据集来自NCBI GEO，对A375SM皮肤黑色素瘤细胞进行PRAME敲低后的转录组测序分析。数据可用于分析PRAME沉默引起的基因表达变化，探索PRAME在黑色素瘤中调控的信号通路，适用于差异表达分析、通路富集及黑色素瘤相关调控机制研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
A375SM皮肤黑色素瘤细胞PRAME敲低RNA-seq表达谱
RNA-seq profiling of PRAME knockdown in A375SM skin cutaneous melanoma cells
该数据集来自NCBI GEO，对A375SM皮肤黑色素瘤细胞进行PRAME敲低后的转录组测序分析。细胞分别转导对照shRNA（shCtrl）和靶向PRAME的shRNA（shPRAME），随后进行双端RNA测序，包含1个文件GSE311500_series_matrix.txt.gz。数据可用于分析PRAME沉默引起的基因表达变化，探索PRAME在黑色素瘤中调控的信号通路，适用于差异表达分析、通路富集及黑色素瘤相关调控机制研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 25 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究探讨了PRAME敲低对A375SM皮肤黑色素瘤细胞系的转录组影响。细胞分别转导对照shRNA（shCtrl）或靶向PRAME的shRNA（shPRAME），随后进行双端RNA测序。该数据集提供了与PRAME沉默相关的基因表达变化，并为黑色素瘤中PRAME调控的通路提供了见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311500
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 31 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了在A375SM皮肤黑色素瘤细胞系中敲低PRAME后的转录组效应。细胞分别转导对照shRNA（shCtrl）或靶向PRAME的shRNA（shPRAME），随后进行配对末端RNA测序。该数据集提供了与PRAME沉默相关的基因表达变化，并为黑色素瘤中PRAME调控的通路提供了见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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