CDK12抑制揭示黑色素瘤依赖RUNX1/CBFβ复合体维持基因组稳定性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308214

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

皮肤黑色素瘤是皮肤癌中最致命的类型，通常由RAS/丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）通路的过度激活驱动。细胞周期蛋白依赖性激酶12（CDK12）作为MAPK信号的下游效应分子，因其在转录调控和DNA损伤修复中的关键作用而成为治疗靶点。为揭示与CDK12抑制相关的脆弱性，我们进行了全基因组CRISPR/Cas9筛选，并鉴定出Runt相关转录因子RUNX1及其辅因子CBFβ为CDK12的合成致死伙伴。抑制RUNX1以不依赖p53的方式增强黑色素瘤对CDK12抑制剂的敏感性，导致DNA损伤积累和修复能力受损。联合抑制CDK12和RUNX1在体内抑制了黑色素瘤生长。这些发现揭示了RUNX1/CBFβ作为CDK12抑制的黑色素瘤中的代偿机制，并建立了一种具有联合治疗转化潜力的新型合成致死相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。