B16F10肿瘤ACT后CD45+细胞scRNA-Seq

该数据集为B16F10黑色素瘤小鼠模型在接受gp100特异性Pmel-1细胞毒性T淋巴细胞过继转移后,于第3、7、14天采集肿瘤并分离CD45⁺免疫细胞进行10x Genomics Chromium单细胞RNA测序

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基因组分类GPL2845710090
GSE299448: scRNA-Seq of CD45+ cells in B16F10 tumor after adoptive cytotoxic T lymphocyte immunotherapy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

B16F10肿瘤ACT后CD45+细胞scRNA-Seq

scRNA-Seq of CD45+ cells in B16F10 tumor after adoptive cytotoxic T lymphocyte immunotherapy

该数据集为B16F10黑色素瘤小鼠模型在接受gp100特异性Pmel-1细胞毒性T淋巴细胞过继转移后,于第3、7、14天采集肿瘤并分离CD45⁺免疫细胞进行10x Genomics Chromium单细胞RNA测序。数据覆盖ACT后肿瘤进展过程中免疫细胞状态的变化,可用于分析肿瘤复发与免疫逃逸相关机制,支持免疫细胞分群、状态注释及差异表达等研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 10 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管使用肿瘤特异性CD8⁺ T细胞的过继性细胞转移(ACT)可诱导初始肿瘤消退,但肿瘤常因清除不完全和免疫逃逸而复发。为研究ACT后肿瘤再生的机制,我们对小鼠黑色素瘤模型中的肿瘤浸润免疫细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。携带B16F10黑色素瘤的C57BL/6小鼠接受gp100特异性Pmel-1细胞毒性T淋巴细胞(CTL)治疗。在转移后第3、7和14天采集肿瘤,分离CD45⁺免疫细胞用于基于10x Genomics Chromium的scRNA-seq。该数据集支持对ACT后肿瘤进展期间免疫细胞状态的分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28457、10090。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299448

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 26 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管采用肿瘤特异性CD8⁺ T细胞的过继性细胞转移(ACT)可诱导初始肿瘤消退,但肿瘤常因未能完全清除和免疫逃逸而复发。为探究ACT后肿瘤再生的机制,我们对小鼠黑色素瘤模型中的肿瘤浸润免疫细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。携带B16F10黑色素瘤的C57BL/6小鼠接受了gp100特异性Pmel-1细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)治疗。在转移后第3、7和14天收集肿瘤,并分离CD45⁺免疫细胞,用于基于10x Genomics Chromium平台的scRNA-seq。该数据集支持对ACT后肿瘤进展过程中免疫细胞状态的分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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