PRAME介导的角质细胞癌维A酸耐药可被EZH2抑制克服

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE271108_series_matrix.txt.gz),主题为角质细胞癌(包括基底细胞癌和皮肤鳞状细胞癌)中PRAME介导的维A酸信号抑制及EZH2抑制的逆转作用

geo
浏览 2
时间序列预测GPL342849606
GSE271108: PRAME-mediated retinoid resistance in keratinocyte carcinomas is overcome by EZH2 inhibition

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

PRAME介导的角质细胞癌维A酸耐药可被EZH2抑制克服

PRAME-mediated retinoid resistance in keratinocyte carcinomas is overcome by EZH2 inhibition

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE271108_series_matrix.txt.gz),主题为角质细胞癌(包括基底细胞癌和皮肤鳞状细胞癌)中PRAME介导的维A酸信号抑制及EZH2抑制的逆转作用。数据通过高通量测序进行表达谱分析,平台为GPL34284,物种为人类(9606)。可用于研究PRAME表达与表皮分化基因特征的关系、维A酸治疗反应预测以及EZH2抑制的潜在治疗价值(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 29 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):黑色素瘤优先表达抗原(PRAME)是一种癌睾丸抗原,在基底细胞癌(BCC)和皮肤鳞状细胞癌(cSCC)的亚群中表达,这两类统称为角质细胞癌(KC)。PRAME作为维A酸信号的转录辅阻遏物,通过将zeste同源物增强子2(EZH2,一种抑制性组蛋白甲基转移酶)引导至基因启动子中的维A酸反应元件(RARE)发挥作用。PRAME在KC中的功能及治疗相关性尚未被研究。在本研究中,我们评估了PRAME表达对KC发展及对维A酸类治疗反应的影响。肿瘤中高PRAME表达与表皮分化基因特征呈负相关。类似地,PRAME过表达(OE)下调了表皮分化基因特征,并且

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271108

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 22 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271108

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

黑色素瘤优先表达抗原(PRAME)是一种癌-睾丸抗原,在基底细胞癌(BCC)和皮肤鳞状细胞癌(cSCC)(统称为角质形成细胞癌(KC))的部分亚型中表达。PRAME通过将抑制性组蛋白甲基转移酶zeste同源物增强子2(EZH2)引导至基因启动子中的视黄酸应答元件(RARE),作为维甲酸信号传导的转录辅阻遏物发挥作用。PRAME在KC中的功能及治疗相关性尚未被研究。在本研究中,我们评估了PRAME表达对KC发展及对维甲酸类治疗应答的影响。肿瘤中PRAME高表达与表皮分化基因特征呈负相关。同样,PRAME过表达(OE)下调表皮分化基因特征,并损害表皮分化。PRAME OE还减弱了维甲酸诱导的RARE激活、生长抑制和分化应答。相反,低PRAME肿瘤和PRAME敲低的KC细胞具有富集的表皮分化基因特征。

PRAME耗竭还恢复了维A酸诱导的RARE激活、KC生长抑制、SCC细胞中角化抑制以及BCC细胞中的细胞死亡信号传导。此外,EZH2抑制剂增强了维A酸诱导的RARE激活,并抑制表达PRAME的BCC和cSCC细胞的生长。我们证明PRAME赋予KC对维A酸的耐药性,并认为KC中PRAME介导的维A酸耐药性可通过靶向EZH2来克服。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案