GSE261681：互锁核心调控回路使Merkel细胞癌遭病毒劫持

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261681

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Merkel细胞癌（MCC）是一种侵袭性神经内分泌皮肤癌。MCC的发病条件和细胞类型尚不清楚。病毒阳性MCC（VP-MCC）由整合的Merkel细胞多瘤病毒（MCPyV）所表达的T抗原驱动。我们发现，VP-MCC需要谱系特异性神经内分泌转录因子（TFs），包括ATOH1、INSM1、ISL1、LHX3、POU4F3和SOX2，这些因子是核心调控（CR）转录回路的核心。MCPyV小T抗原与宿主CR转录因子共同结合VP-MCC超级增强子，而T抗原表达直接受LHX3和ISL1调控，从而建立了宿主CR回路与肿瘤病毒之间的互锁网络。此外，MCPyV整合位点在VP-MCC超级增强子附近富集，进一步提示病毒致癌与核心神经内分泌回路之间存在功能关系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。