非黑色素瘤皮肤癌的新型分子标志物
该数据集来自 NCBI GEO（GSE2503），主题为非黑色素瘤皮肤癌的新型分子标志物，采用表达谱芯片技术，平台为 GPL96，物种为人类（9606）
基本信息
资源简介
非黑色素瘤皮肤癌的新型分子标志物
GSE2503 是一个聚焦非黑色素瘤皮肤癌新型分子标志物的基因表达谱数据集，来源于 NCBI GEO 公共数据库，本站将其归入肿瘤 / 皮肤癌分类。该数据集围绕正常皮肤、光化性角化病与皮肤鳞状细胞癌三类样本展开表达谱检测，采用芯片技术获取转录层面的分子信息，平台为 GPL96，物种为人类（9606）。数据集由 Ingo、Nindl 提交，发布时间为 2000 年 4 月 6 日，共包含 1 个数据文件，样例文件名为 GSE2503_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集适合用于探索非黑色素瘤皮肤癌发生发展过程中的候选分子标志物，并为皮肤癌相关表达谱分析提供公开可获取的数据基础。
【数据集背景】
非黑色素瘤皮肤癌是皮肤肿瘤中的重要类型，其发生通常涉及从正常皮肤到癌前病变再到浸润性癌的多阶段过程。GSE2503 以“非黑色素瘤皮肤癌的新型分子标志物”为主题，正是围绕这一过程寻找在转录水平上具有区分意义的分子特征。源站描述明确指出，该研究考察了正常皮肤、光化性角化病以及皮肤鳞状细胞癌三类样本，这为比较癌前病变与癌组织之间的表达差异提供了素材。数据集发表于 2000 年 4 月 6 日，作者为 Ingo、Nindl，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 平台上的公共表达谱资源。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括 Expression profiling by array、GPL96 与 9606，分别对应芯片表达谱、所用芯片平台以及人类物种。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE2503_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达矩阵信息，可用于后续的样本分组比较与差异表达分析。源站描述仅列出正常皮肤、光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌三类被检样本，未提供样本数量、基因数量、分组重复数等更细的统计信息。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO，源站地址为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号为 GSE2503。提交者为 Ingo、Nindl，发布时间为 2000 年 4 月 6 日。检测对象为人类皮肤相关样本，包括正常皮肤、光化性角化病与皮肤鳞状细胞癌。检测技术为表达谱芯片，平台编号为 GPL96。除上述信息外，样本采集地点、伦理审批、RNA 提取与杂交实验流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于非黑色素瘤皮肤癌分子标志物的探索性研究，例如比较正常皮肤、癌前病变光化性角化病与皮肤鳞状细胞癌之间的表达谱差异，筛选候选标志基因，或作为皮肤癌表达谱分析的外部验证数据。由于采用芯片表达谱技术且平台为 GPL96，也可用于与其他同平台人类表达谱数据集的整合分析或方法学比较。需要说明的是，具体分析目标应结合样本构成与数据质量评估后确定，源站未提供针对特定分析场景的推荐。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE2503_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段结构、样本分组标签与编码方式，确认无误后再批量接入分析流程。由于文件为系列矩阵形式，读取后应重点检查样本列与表达值列的对应关系，并结合源站描述中的三类样本信息进行分组。若需进行跨平台比较，应注意平台注释的匹配问题。源站未提供额外的预处理脚本或分析代码。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，样本数量、重复设置、数据标准化方式与质控指标等信息源站未提供，因此在未核对数据前不宜对统计效能作出判断。发布时间为 2000 年 4 月 6 日，属于较早的芯片表达谱数据，平台注释与基因覆盖范围可能受当时技术条件限制。此外，源站描述仅简要列出三类被检样本，未说明临床分期、年龄、性别等样本元数据，限制了分层分析的可行性。使用时应结合小样本核对结果评估数据适用性。
【引用与许可】
数据集作者为 Ingo、Nindl，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号为 GSE2503。引用时应遵循 NCBI GEO 的引用规范并注明数据集编号与作者信息。关于数据许可条款、使用限制与再分发条件，源站未提供，使用前应自行查阅 NCBI GEO 的相关政策说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2503
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对正常皮肤（no）、光化性角化病（ak）和皮肤鳞状细胞癌（scc）进行了研究：癌变是一个多步骤过程，表现为肿瘤进展过程中若干基因的上调或下调。参与非黑色素瘤皮肤癌（NMSC）的基因类型和数量仍不清楚。本研究检测并鉴定了NMSC中的差异表达基因。分析了来自五名免疫抑制器官移植受者的十五份速冻活检组织，每名受者均包含正常皮肤、光化性角化病（AK）和浸润性鳞状细胞癌（SCC）样本。提取总RNA，逆转录后，将生物素标记的cRNA与Affymetrix HG-U133A基因表达cDNA微阵列杂交，该微阵列包含22,283个已知基因。共聚焦扫描仪对信号进行两次评估，数据分析通过微阵列预测分析（PAM）完成，使用最近收缩中心法，阈值设为3.5，以鉴定最能表征正常皮肤和皮肤癌的基因。作为第二种独立方法，进行方差分析（ANOVA）以鉴定差异表达基因（p<0.05和p<0.15）。
通过实时RT-PCR对13个上调或下调基因进行了定量验证，并通过测序对基因进行了确认。在正常皮肤与AK及SCC之间观察到118个基因的广泛一致模式。我们研究中在癌中上调的一些基因（例如膜联蛋白、层粘连蛋白和金属蛋白酶）此前已有报道在NMSC中过表达。在非黑色素瘤皮肤癌中，共有42个基因上调，76个基因下调。所鉴定的大多数基因此前未被报道在非黑色素瘤皮肤癌发生过程中存在差异表达。关键词：有序
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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