人组织驻留CD8+ T细胞中CD49a表达与细胞毒性诱导受RUNX2和RUNX3转录因子活性调控 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232236

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CD49a标志着高细胞毒性表皮组织驻留记忆（TRM）细胞，但其分子机制及其与循环细胞群的关系尚不明确。我们发现，人表皮CD8+CD103+CD49a+ TRM细胞中RUNX家族转录因子结合基序富集，同时伴有RUNX2和RUNX3蛋白的高表达。表皮CD8+CD103+CD49a+ TRM细胞与循环记忆CD8+CD45RA–CD62L+ T细胞之间的克隆重叠揭示了一个循环细胞库，这些细胞有潜力在新部位播种细胞毒性TRM细胞。在IL-15和TGF-β刺激下，部分循环CD8+CD45RA–CD62L+ T细胞以依赖RUNX2和RUNX3的方式获得了CD49a表达和细胞毒性转录谱。相反，敲除RUNX3而非RUNX2，阻止了CD103的表达。在黑色素瘤中，高RUNX2而非RUNX3转录与细胞毒性CD8+CD103+CD49a+ TRM细胞特征及患者总体生存率相关。综上所述，我们的结果表明，RUNX2和RUNX3的联合活性促进了细胞毒性CD8+CD103+CD49a+ TRM细胞的分化，从而对感染和恶性细胞提供免疫监视。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。