葡萄膜黑色素瘤DNA拓扑分析数据集
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，聚焦葡萄膜黑色素瘤的染色质结构与 DNA 拓扑。为阐明基因表达调控是否与染色质组织和 DNA 折叠相关，研究对两种葡萄膜黑色素瘤模型的染色质结构和 DNA 拓扑进行了分析，揭示恶性和正常葡萄膜黑色素细胞中稳定的 compartments 和 TADs，
基本信息
资源简介
葡萄膜黑色素瘤DNA拓扑分析数据集
DNA topology analysis reveals stable compartments and TADs in malignant and normal uveal melanocytes as novel molecular features of uveal melanoma
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，聚焦葡萄膜黑色素瘤的染色质结构与 DNA 拓扑。为阐明基因表达调控是否与染色质组织和 DNA 折叠相关，研究对两种葡萄膜黑色素瘤模型的染色质结构和 DNA 拓扑进行了分析，揭示恶性和正常葡萄膜黑色素细胞中稳定的 compartments 和 TADs，并将其作为葡萄膜黑色素瘤的新分子特征。数据包含 1 个文件，样例为 GSE201727_series_matrix.txt.gz，可用于探索染色质构象与基因表达调控的关系（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Apr 27 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了阐明基因表达调控是否可能与染色质组织和 DNA 折叠相关，我们研究了两种葡萄膜黑色素瘤模型的染色质结构和 DNA 拓扑。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL11154、9606。本站分类：肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE201727
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 13 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE201727
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了阐明基因表达调控是否与染色质组织和DNA折叠有关，我们研究了两种葡萄膜黑色素瘤模型的染色质结构和DNA拓扑。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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