肢端黑色素瘤整合分子与临床分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE190113

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肢端黑色素瘤是非高加索人群中最为常见的黑色素瘤亚型，与不良预后相关。然而，其关键分子驱动因素仍不清楚。在此，我们对来自北美或中国接受治疗的104例患者队列的肢端黑色素瘤进行了整合基因组和临床分析。我们发现，细胞遗传带chr22q11.21的反复性、晚期出现的扩增是导致较差生存的主要决定因素，与转移密切相关，并与对免疫检查点阻断应答相关的免疫调节基因下调有关。出乎意料的是，LZTR1——在其他癌症中已知的肿瘤抑制因子——是该细胞遗传带中的关键候选癌基因。在黑色素瘤细胞系中沉默LZTR1可引起凋亡性细胞死亡，且不依赖于主要热点突变或黑色素瘤亚型。相反，在正常人黑素细胞中过表达LZTR1可启动与转移相关的过程，包括锚定非依赖性生长、球体形成以及MAPK和SRC活性水平升高。我们的结果为肢端黑色素瘤的病因学提供了新的见解，并表明LZTR1是关键肿瘤促进因子和治疗靶点。

关键词：高通量测序表达谱分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。