GSE163942:miR122与miR144经ADAM10和C-Met抑制在葡萄膜黑色素瘤中的潜在抑癌作用
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦葡萄膜黑色素瘤(UM)中 miR122 与 miR144 通过调控 ADAM10 和 c-Met 发挥潜在抑癌作用的研究

基本信息
资源简介
GSE163942:miR122与miR144经ADAM10和C-Met抑制在葡萄膜黑色素瘤中的潜在抑癌作用
Potential Onco-Suppressive Role of miR122 and miR144 in Uveal Melanoma through ADAM10 and C-Met Inhibition
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦葡萄膜黑色素瘤(UM)中 miR122 与 miR144 通过调控 ADAM10 和 c-Met 发挥潜在抑癌作用的研究。数据包含 1 个文件 GSE163942_series_matrix.txt.gz,基于 GPL29542 平台,属于 Non-coding RNA profiling by array,物种为 9606(人)。研究涉及 TCGA UM 数据集、两个原发肿瘤队列及五个人 UM 细胞系,采用 miR 微阵列、RT-qPCR、Western blotting、miR 转染和荧光素酶报告实验。该数据可用于分析 miRNA 表达谱,探索 UM 中 miRNA 与转移相关分子的关系(来源。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):葡萄膜黑色素瘤(UM)是一种罕见的眼部肿瘤,约半数患者会发生致命的转移。ADAM10 与 UM 中的 c-Met 表达相关,且这两种分子的高水平与转移的发生有关。MiR122 和 miR144 在不同环境中调节 ADAM10 和 c-Met 表达。我们假设 miR122 和 miR144 通过调节 UM 中的 ADAM10 和 c-Met 发挥潜在的抑癌作用。我们通过 miR 微阵列、RT-qPCR、Western blotting、miR 转染和荧光素酶报告实验,分析了 UM 癌症基因组图谱数据门户(TCGA)数据集、另外两个原发肿瘤队列和五个人 UM 细胞系中 miR122 和 miR144 的表达。我们的结果表明,miR122 和 miR144 在 UM 细胞系和 TCGA UM 数据集中低水平表达,并且在七个 UM 样本的队列中相较于正常脉络膜下调。两者
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL29542、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163942
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 31 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
葡萄膜黑色素瘤(UM)是一种罕见的眼部肿瘤,约半数患者会发生致命的转移。ADAM10与UM中c-Met的表达相关,且这两种分子的高水平与转移的发生有关。MiR122和miR144在不同环境中调节ADAM10和c-Met的表达。我们假设miR122和miR144通过调节UM中的ADAM10和c-Met发挥潜在的抑癌作用。我们通过miR微阵列、RT-qPCR、Western印迹、miR转染和荧光素酶报告基因实验,分析了UM癌症基因组图谱数据门户(TCGA)数据集、另外两个原发肿瘤队列和五种人UM细胞系中miR122和miR144的表达。我们的结果表明,与正常脉络膜相比,miR122和miR144在UM细胞系和TCGA UM数据集中表达水平较低,并在七个UM样本队列中下调。miR122和miR144均直接靶向ADAM10和c-Met。miR122和miR144的过表达导致UM细胞系中ADAM10和c-Met表达减少,并损害细胞增殖、迁移、细胞周期以及c-Met胞外域的脱落。
我们的结果显示,miR122和miR144通过调节ADAM10和c-Met,在UM中发挥抑癌作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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