SREBF2诱导循环黑色素瘤细胞中转铁蛋白并抑制铁死亡
该数据集来自NCBI,标题为SREBF2诱导循环黑色素瘤细胞中转铁蛋白并抑制铁死亡,属于肿瘤/皮肤癌分类。源站描述指出这是一个SuperSeries,由下方列出的SubSeries组成

基本信息
资源简介
SREBF2诱导循环黑色素瘤细胞中转铁蛋白并抑制铁死亡
GSE157745 是一个来自 NCBI 的基因表达数据集,标题为“The lipogenic regulator SREBF2 induces Transferrin in circulating melanoma cells and suppresses ferroptosis”,中文可译为“脂质合成调控因子 SREBF2 在循环黑色素瘤细胞中诱导转铁蛋白并抑制铁死亡”。该数据集归属于肿瘤/皮肤癌分类,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台编号为 GPL18573。数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,当前提供 1 个数据文件,样例文件名为 GSE157745_series_matrix.txt.gz。该数据集可用于研究黑色素瘤循环肿瘤细胞中 SREBF2、转铁蛋白与铁死亡之间的调控关系,适合作为基因表达分析及相关分子机制探索的数据资源。
【数据集背景】
该数据集围绕黑色素瘤中脂质代谢调控与铁死亡之间的关联展开。标题明确指出研究对象为脂质合成调控因子 SREBF2,其在循环黑色素瘤细胞中诱导转铁蛋白(Transferrin)表达,并抑制铁死亡过程。这一主题涉及肿瘤细胞在循环环境中的存活机制,以及代谢调控与细胞死亡通路之间的相互作用。数据集所属分类为肿瘤/皮肤癌,说明其应用背景集中在肿瘤生物学与皮肤癌研究领域。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体研究设计。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE157745_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签显示其数据类型为高通量测序表达谱分析(Expression profiling by high throughput sequencing),平台为 GPL18573,物种编号为 9606(人)。表达谱矩阵文件通常包含样本层面的表达测量值及样本注释信息,但具体包含多少样本、检测多少基因或转录本、分组设计如何,源站未提供。该数据集作为 SuperSeries,其组成 SubSeries 的具体内容与数量,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI 数据库。作者信息记为 Ben,S.,Wittner。发布时间记为 Sep 09 202,该日期字段本身不完整,源站未提供更完整的发布日期说明。数据集通过高通量测序平台 GPL18573 产生表达谱数据,物种为人。样本采集的具体组织类型、细胞来源、处理条件、测序策略与建库方法等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤/皮肤癌方向的基因表达研究,尤其是黑色素瘤循环肿瘤细胞相关的分子机制探索。研究者可基于表达谱数据考察 SREBF2 与转铁蛋白表达之间的关系,以及铁死亡相关基因的表达模式。由于数据来自高通量测序表达谱,可用于差异表达分析、通路富集分析、候选基因筛选等通用分析场景。此外,作为 SuperSeries,它也可作为定位其下属 SubSeries 的入口,便于按子系列获取更细粒度的数据。具体研究设计与适用分析类型需结合原始数据判断,源站未提供详细说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE157745_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认样本注释、表达值格式与缺失值表示方式无误后,再批量接入分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析前应确认所需数据是否位于其 SubSeries 中,并按需获取对应子系列文件。分析时可结合平台注释信息将探针或转录本映射到基因层面,再进行表达比较与可视化。具体分析流程与参数设置应依据研究目的确定,源站未提供推荐的分析步骤。
【质量与限制】
当前可确认的信息包括文件数量为 1、文件格式为 GZIP 压缩包、数据类型为高通量测序表达谱、物种为人、平台为 GPL18573。样本量、测序深度、重复数、质控指标、批次信息与数据完整性等质量相关细节,源站未提供。由于该数据集为 SuperSeries,仅凭当前文件可能不足以覆盖全部子系列内容,使用前需核实数据范围。发布日期字段不完整,可能影响版本追溯。使用者在分析前应自行评估数据质量与适用性。
【引用与许可】
引用该数据集时应参考源站标题“The lipogenic regulator SREBF2 induces Transferrin in circulating melanoma cells and suppresses ferroptosis”及作者信息 Ben,S.,Wittner,并注明来源站 ncbi.nlm.nih.gov 与数据集编号 GSE157745。数据许可条款、使用限制与再分发规定,源站未提供,使用前应查阅 NCBI 相关页面确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE157745
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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