GSE157744：脂质生成调节因子SREBF2在循环黑色素瘤细胞中诱导转铁蛋白并抑制铁死亡[TF敲低RNA测序]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE157744

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数据说明

循环肿瘤细胞（CTCs）由肿瘤脱落进入血流，其中具有活力的亚群能够克服氧化应激，启动转移性生长。本研究表明，来自BRAF突变型黑色素瘤患者的CTCs协同上调脂质合成与铁稳态通路。在黑色素瘤CTCs的克隆来源培养物中，这些通路与对BRAF抑制剂的原发性和获得性耐药均相关。脂质合成调控因子SREBF2直接诱导铁载体转铁蛋白（TF）的转录，降低细胞内铁池、活性氧（ROS）及脂质过氧化水平，并赋予对BRAF抑制剂及铁死亡诱导剂的耐药性。敲低内源性TF可损害黑色素瘤CTCs的肿瘤形成能力，而其致瘤缺陷可被亲脂性抗氧化剂Ferrostatin-1和维生素E部分挽救。在一组患者来源的黑色素瘤CTCs中，单细胞RNA测序鉴定出一个具有高脂质合成、铁代谢及增殖特征的亚群，该亚群与不良临床结局相关，且与治疗方案无关。

因此，SREBF2驱动的铁稳态通路促进了癌症进展、耐药性和转移。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。