ICG-001 调控葡萄膜黑色素瘤细胞基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE149417

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了ICG-001对Mel202葡萄膜黑色素瘤(UM)细胞基因表达的影响。ICG-001对UM细胞表现出强烈的抗增殖活性，导致细胞周期停滞、凋亡及迁移抑制。全局基因表达谱分析显示，与细胞周期增殖、DNA复制及G1/S转换相关的基因受到强烈抑制。基因集富集分析表明，ICG-001抑制了Wnt、mTOR和MAPK信号通路。引人注目的是，ICG-001还抑制了与UM侵袭性相关的基因表达，包括CDH1、CITED1、EMP1、EMP3、SDCBP和SPARC。值得注意的是，将ICG-001的转录组足迹应用于UM患者数据集时，与更好的临床结果相关联。最后，ICG-001在小鼠UM肿瘤异种移植模型中展现了抗癌活性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。