GSE100158:用于临床免疫监测的转录组指纹图谱检测(黑色素瘤数据集)
数据基于表达谱芯片,涉及 GPL6884 平台与人类样本,用于开发一种经济实用的靶向转录指纹图谱检测(TFA),以监测人类血液转录组中多样的免疫反应

基本信息
资源简介
GSE100158:用于临床免疫监测的转录组指纹图谱检测(黑色素瘤数据集)
A Transcriptome Fingerprinting Assay for Clinical Immune Monitoring (Melanoma Datasets)
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 A Transcriptome Fingerprinting Assay for Clinical Immune Monitoring (Melanoma Datasets),属于肿瘤/皮肤癌分类,包含 1 个文件 GSE100158_series_matrix.txt.gz。数据基于表达谱芯片,涉及 GPL6884 平台与人类样本,用于开发一种经济实用的靶向转录指纹图谱检测(TFA),以监测人类血液转录组中多样的免疫反应。该检测依赖模块化转录组库,该库基于近 1000 名受试者、16 种免疫状态下全基因组范围的转录本丰度变异构建,可用于免疫监测相关研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 19 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):开发一种经济高效且实用的靶向转录指纹图谱检测(TFA),用于监测人类血液转录组中识别出的多样免疫反应,该检测依赖于一个模块化转录组库,该库基于近 1000 名受试者、16 种免疫状态下全基因组范围测量的转录本丰度变异构建。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6884、9606。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE100158
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 26 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE100158
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
开发了一种成本效益高且实用的靶向转录指纹分析(TFA),用于监测在人类血液转录组中识别出的多样免疫反应。该方法依赖于一个模块化转录库,该库基于对近1000名受试者、涵盖16种免疫学状况的血液中全基因组范围内转录本丰度变化的测量而构建。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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