Duke黑色素瘤脑转移基因组特征数据集

该数据集为Duke黑色素瘤脑转移的基因组特征数据,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/皮肤癌。数据围绕黑色素瘤脑转移的基因组学展开,可用于研究该疾病的基因组变异特征及相关分析(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
Genomic Characterization of Duke Melanoma Brain Metastases

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

Duke黑色素瘤脑转移基因组特征数据集

Genomic Characterization of Duke Melanoma Brain Metastases 是一个围绕黑色素瘤脑转移展开的基因组特征数据集,英文名称即为其正式标识。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 皮肤癌方向,主题标签为 Genomics,来源站为 omicsdi.org。从整体定位看,该数据集聚焦于 Duke 黑色素瘤脑转移样本的基因组学特征,属于肿瘤基因组学与皮肤癌研究交叉领域的数据资源。其核心价值在于为研究者提供与黑色素瘤脑转移相关的基因组层面信息,支撑对该疾病基因组变异特征的认识与后续分析。数据集名称中的 Duke 指向其样本或研究背景的来源机构,而 Melanoma Brain Metastases 则明确了其关注的疾病场景,即黑色素瘤向脑部转移这一临床与科研上均具有挑战性的情形。整体而言,该数据集以基因组学为主线,服务于黑色素瘤脑转移的基础与转化研究。

【数据集背景】

黑色素瘤是皮肤癌中恶性程度较高的一类,脑转移是其疾病进展中的重要环节,也是影响患者预后的关键因素之一。针对黑色素瘤脑转移开展基因组层面的刻画,有助于理解该疾病在分子水平上的特征。该数据集正是以 Duke 黑色素瘤脑转移为对象,围绕基因组特征进行组织与描述,主题标签为 Genomics,分类归属为肿瘤 / 皮肤癌。其英文名称 Genomic Characterization of Duke Melanoma Brain Metastases 直接体现了数据集的研究对象与数据性质,即对 Duke 相关黑色素瘤脑转移样本进行基因组特征层面的表征。该数据集来源于 omicsdi.org,属于组学数据资源体系中的一部分,面向肿瘤基因组学研究场景。

【数据内容】

该数据集的内容围绕黑色素瘤脑转移的基因组学展开,主题标签为 Genomics,表明其数据主体属于基因组学范畴。数据集名称强调“基因组特征”(Genomic Characterization),说明其内容侧重于对黑色素瘤脑转移在基因组层面的特征进行描述与呈现。关于具体的样本数量、测序平台、变异类型、数据文件格式等细节,源站未提供。数据集在分类上归入肿瘤 / 皮肤癌,提示其内容与肿瘤学及皮肤癌研究方向直接相关。整体而言,数据内容以基因组特征信息为核心,服务于对黑色素瘤脑转移分子特征的研究与分析。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。数据集英文名称为 Genomic Characterization of Duke Melanoma Brain Metastases,名称中体现的 Duke 指向其研究或样本背景。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、样本处理流程以及数据产生所采用的技术平台等,源站未提供。该数据集在来源站上的描述与其英文名称一致,未给出更多关于采集过程的细节。因此,在采集与来源方面,可确认的信息主要为来源站为 omicsdi.org,以及数据集名称所体现的 Duke 黑色素瘤脑转移研究背景。

【适用场景】

基于其主题标签与分类,该数据集适用于肿瘤基因组学与皮肤癌相关研究场景,尤其是围绕黑色素瘤脑转移的基因组特征分析。研究者可将其用于探索黑色素瘤脑转移在基因组层面的变异特征,开展相关的比较分析或分子特征描述性研究。由于数据集归类于肿瘤 / 皮肤癌,其潜在应用还包括与皮肤癌其他研究方向进行对照或整合分析的场景。关于具体的分析类型、可支持的统计或建模任务,源站未提供进一步说明。总体而言,该数据集的适用场景以黑色素瘤脑转移的基因组学研究为核心,服务于对该疾病分子特征的认识与相关分析。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、文件组织格式、访问接口、分析流程与工具要求等,源站未提供。使用者可依据来源站 omicsdi.org 的通用数据访问机制进行查找与获取,但针对该数据集的具体使用说明,现有信息不足以给出详细指引。

【质量与限制】

关于该数据集的质量评估信息,如数据完整性、准确性、批次效应、样本量、覆盖度等指标,源站未提供。其限制方面,可确认的信息仅为数据集名称与主题标签所界定的范围,即聚焦于 Duke 黑色素瘤脑转移的基因组特征;关于数据规模、样本代表性以及是否包含临床关联信息等,源站未提供。因此,在使用该数据集时,需注意其具体质量与限制细节尚缺乏来源站层面的说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考来源站 omicsdi.org 的相关规定,但针对该数据集的具体引用格式与许可信息,现有信息不足以给出明确说明。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA865438

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Genomic Characterization of Duke Melanoma Brain Metastases

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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