脑转移倾向患者颅外转移灶基因表达分析数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-60464

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为检验基因表达与嗜脑性之间的关联，采用了Wilcoxon秩和检验，结果揭示两组患者之间有超过400个基因存在差异表达。请注意，此处嗜脑性定义为IV期疾病后6个月内发生脑转移。在本研究中，我们利用了一个注释完善的转移性黑色素瘤病例队列，获取了总共9,829个独特基因的表达谱。嗜脑性状态（在每个样本特征字段中提供）：1代表早期嗜脑性患者（在诊断转移性疾病后6个月内发生CNS转移的患者），0代表非嗜脑性患者（超过18个月未发生脑转移的患者）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。