慢性砷暴露人角质形成细胞中差异表达miRNA的差异表达mRNA靶点预测TP53轴及癌变相关通路变化

该数据集来自search.dataone.org,属于肿瘤/皮肤癌分类,围绕慢性砷暴露诱导皮肤癌的机制研究。数据基于永生化人角质形成细胞(HaCaT)在0/100 nM NaAsO2条件下处理3周和7周,使用Affymetrix微阵列检测miRNA与mRNA表达,并从TargetScan 6.2收集

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医学影像分类Homo SapiensTransformationTP53Arsenicskin cancermRNAMiRNA
Differentially expressed mRNA targets of differentially expressed miRNAs predict changes in the TP53 axis and carcinogenesis related pathways in human keratinocytes chronically exposed to arsenic

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

慢性砷暴露人角质形成细胞中差异表达miRNA的差异表达mRNA靶点预测TP53轴及癌变相关通路变化

Differentially expressed mRNA targets of differentially expressed miRNAs predict changes in the TP53 axis and carcinogenesis related pathways in human keratinocytes chronically exposed to arsenic

该数据集来自search.dataone.org,属于肿瘤/皮肤癌分类,围绕慢性砷暴露诱导皮肤癌的机制研究。数据基于永生化人角质形成细胞(HaCaT)在0/100 nM NaAsO2条件下处理3周和7周,使用Affymetrix微阵列检测miRNA与mRNA表达,并从TargetScan 6.2收集差异表达miRNA的靶点,与差异表达mRNA取交集。数据可用于探索砷暴露早期miRNA表达变化、差异表达miRNA靶向mRNA对TP53轴及癌变相关通路的预测作用(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:砷是一种广泛分布的有毒天然元素。长期摄入砷会导致多种癌症,尤其是皮肤癌。砷致癌机制尚不明确,但多项研究表明突变并非驱动因素,microRNA表达变化在其中发挥作用。长期低浓度亚砷酸盐暴露可使永生化人角质形成细胞(HaCaT)恶性转化,作为砷诱导皮肤癌变的模型。假设:长期暴露于亚砷酸盐的HaCaT细胞中miRNA表达的早期变化将揭示转化早期步骤。方法:HaCaT细胞在0/100 nM NaAsO2条件下维持3周和7周。纯化总RNA。使用Affymetrix微阵列检测miRNA和mRNA表达。从TargetScan 6.2收集差异表达miRNA的靶点,与差异表达mRNA取交集。

【主题与分类】

主题标签:Homo Sapiens、Transformation、TP53、Arsenic、skin cancer、mRNA、MiRNA。本站分类:肿瘤/皮肤癌。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Acc314031d4585476288f9d4f00f969b05c6a2a9ae7562f515ff5f123a65e418b

使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:砷是一种广泛分布的有毒天然元素。长期摄入砷会导致多种癌症,尤其是皮肤癌。砷致癌机制尚不明确,但多项研究表明突变并非驱动因素,而microRNA表达改变在其中发挥作用。长期低浓度亚砷酸盐暴露可使永生化人角质形成细胞(HaCaT)发生恶性转化,作为砷致皮肤癌的模型。假设:长期暴露于亚砷酸盐的HaCaT细胞中miRNA表达的早期变化将揭示转化过程的早期步骤。方法:将HaCaT细胞分别用0/100 nM NaAsO2维持3周和7周。纯化总RNA。使用Affymetrix微阵列检测miRNA和mRNA表达。从TargetScan 6.2中收集差异表达miRNA的靶标,使用Partek Genomic Suiteâ软件与差异表达mRNA取交集,并使用MetaCoreâ软件映射至其通路。MDM2,……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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