基于CRISPR/Cas12a系统在液体活检中检测BRAF V600E突变
该数据集来自clinicaltrials.gov，聚焦不可切除转移性黑色素瘤患者疾病复发后BRAF V600E突变的检测
基本信息
资源简介
基于CRISPR/Cas12a系统在液体活检中检测BRAF V600E突变
该数据集英文名为 Detection of the BRAF V600E Mutation in Liquid Biopsy Using the CRISPR/Cas12a System，来源于 clinicaltrials.gov，本站归类为肿瘤 / 皮肤癌，主题聚焦不可切除转移性黑色素瘤。源站描述显示，这是一项前瞻性、低干预性研究，旨在开发一种诊断工具，并对该工具进行分析性能与临床性能验证，用于检测不可切除转移性黑色素瘤患者疾病复发后的 BRAF V600E 突变。所开发方法面向个性化医疗的潜在应用，尤其用于优化治疗策略，以及对治疗反应和疾病进展进行纵向监测。其诊断思路基于 CRISPR/Cas12a 系统，结合等温扩增与终点电化学检测。
【数据集背景】
该数据集对应的研究背景是不可切除转移性黑色素瘤患者在疾病复发后的分子检测需求。源站描述明确指出，研究目标是开发并验证一种用于检测 BRAF V600E 突变的诊断工具，且该工具面向个性化医疗中的潜在用途，包括优化治疗策略以及纵向监测治疗反应和疾病进展。研究设计为前瞻性、低干预性研究，检测对象为液体活检样本中的 BRAF V600E 突变。
【数据内容】
源站描述显示，该数据集所涉检测方法由三部分技术构成：CRISPR/Cas12a 系统、等温扩增和终点电化学检测。其中，CRISPR/Cas12a 系统用于选择性降解未突变的野生型 DNA 序列；等温扩增作为传统 PCR 扩增的快速、简便替代方案；扩增后的目标产物随后进行终点电化学检测。源站描述在“The amplified target will subsequently be de”处截断，后续内容未提供。数据集的具体样本量、字段结构、变量类型和记录数量，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 clinicaltrials.gov，属于临床试验注册信息。源站描述表明研究为前瞻性、低干预性设计，受试人群为不可切除转移性黑色素瘤患者，检测场景为疾病复发后的液体活检。关于样本采集时间窗、采集机构、样本类型细分、随访周期和数据采集流程，源站未提供。
【适用场景】
依据源站描述，该数据集及相关方法适用于不可切除转移性黑色素瘤患者疾病复发后 BRAF V600E 突变的检测，潜在应用包括个性化医疗中的治疗策略优化，以及治疗反应和疾病进展的纵向监测。检测技术路线适用于液体活检场景，并以等温扩增替代传统 PCR 扩增、以终点电化学检测作为读出方式。其他适用场景源站未提供。
【使用方法】
源站描述仅说明检测方法的技术流程：CRISPR/Cas12a 系统选择性降解野生型 DNA 序列，等温扩增提供快速简便的扩增替代方案，扩增目标随后进行终点电化学检测。关于数据访问方式、使用许可、分析软件、数据处理步骤和结果判读标准，源站未提供。
【质量与限制】
源站描述提及该研究将对所开发诊断工具进行分析性能验证和临床性能验证，但未给出具体性能指标、验证结果或质量控制措施。源站描述在扩增目标后续处理处截断，方法描述的完整性受限。数据集样本规模、代表性、随访完整性和偏倚控制信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 clinicaltrials.gov。关于引用格式、许可条款和使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07870265
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件：不可切除的转移性黑色素瘤。这项前瞻性、低干预研究旨在开发一种诊断工具，并在分析和临床上对其进行验证，用于检测疾病复发后不可切除转移性黑色素瘤患者的BRAF V600E突变。所开发的方法拟用于个性化医疗，特别是用于优化治疗策略以及对治疗反应和疾病进展进行纵向监测。该诊断方法将基于CRISPR/Cas12a系统，结合等温扩增和终点电化学检测。CRISPR/Cas12a系统将用于选择性降解未突变（野生型）DNA序列，而等温扩增将提供一种快速、简便的替代传统PCR扩增的方法。扩增后的靶标随后将使用基于电极芯片和相对低成本仪器的电化学方法进行检测。
本研究的主要目标是开发并验证所提出的电化学方法，用于检测从血浆中分离的循环游离DNA（cfDNA）中的BRAF V600E突变。将通过与该领域已有的参考方法进行比较来评估新方法的分析和临床性能，这些参考方法包括下一代测序（NGS）和/或微滴数字PCR（ddPCR）。次要目标包括评估治疗期间循环DNA中BRAF V600E突变的存在和水平变化，以及评估循环肿瘤DNA（ctDNA）的纵向变化在早期发现疾病进展或治疗耐药方面的潜力。新方法获得的电化学信号将与使用参考方法获得的相应结果进行相关性分析。对于NGS，结果将与相应的测序发现进行比较；而对于ddPCR，电化学信号将与BRAF V600E阳性微滴数进行比较。敏感性
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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