免疫抑制性与非抑制性黑色素瘤细胞系的比较基因表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-44851

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

I型干扰素（IFN）信号通路功能障碍发生于II期或更晚期癌症患者中。在筛选一组12种黑色素瘤细胞系对健康志愿者外周血单核细胞（PBMC）中IFNα信号通路的影响后，可识别出两组黑色素瘤细胞系，其中一组（低pSTAT-1组）比另一组（高pSTAT-1组）具有更强的抑制作用。两组之间的全局基因表达比较鉴定出6771个差异表达基因。该基因列表表明免疫抑制性黑色素瘤细胞中IFNα信号下调。为评估该基因列表对IFNα信号调节功能的预测能力，我们分析了41个独立黑色素瘤细胞系的基因表达，热图将这些细胞系聚类为两组，一组具有强免疫抑制功能，另一组效果较弱。对53个黑色素瘤细胞系进行了十二次技术重复分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。