转移性实体瘤及新诊断脑转移患者血浆循环小细胞外囊泡特征

该数据集来自 omicsdi.org,聚焦转移性实体瘤及新诊断脑转移患者血浆循环小细胞外囊泡的特征分析,覆盖肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤等实体瘤类型

omicsdi
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蛋白质预测Proteomics
Characterization of plasma circulating small extracellular vesicles in patients with metastatic solid tumors and newly diagnosed brain metastasis

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

转移性实体瘤及新诊断脑转移患者血浆循环小细胞外囊泡特征

该数据集英文名为“Characterization of plasma circulating small extracellular vesicles in patients with metastatic solid tumors and newly diagnosed brain metastasis”,来自 omicsdi.org,本站归类为肿瘤 / 皮肤癌,主题标签为 Proteomics。数据集聚焦转移性实体瘤及新诊断脑转移患者血浆循环小细胞外囊泡的特征分析,覆盖肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤等实体瘤类型。源站描述指出,脑转移影响近50%肿瘤患者的结局与生活质量,通常伴随较差的短期预后,早期或预防性诊断该并发症仍是未被满足的需求,亟需发现有助于预测疾病结局的新生物标志物。该研究分析了92例不同实体瘤患者血浆循环细胞外囊泡,发现新诊断脑转移患者相较无脑转移患者和健康对照,循环颗粒数量更低、小细胞外囊泡中蛋白浓度更高;在所有分析组中,伴脑转移的黑色素瘤患者循环中STAT3活化降低、PD-L1水平升高。

【数据集背景】

脑转移是肿瘤患者预后和生活质量的重要影响因素,源站描述提到其影响近50%的肿瘤患者,一般与较差的短期预后相关。早期或预防性诊断这一并发症存在未被满足的临床需求,因此需要发现能够帮助预测疾病结局的新生物标志物。该数据集围绕转移性实体瘤患者血浆循环小细胞外囊泡展开特征分析,关注新诊断脑转移这一临床情形,涉及肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤等实体瘤类型。主题标签为 Proteomics,表明其与蛋白质组学分析相关。

【数据内容】

源站描述显示,该研究分析了一组92例不同实体瘤患者血浆循环细胞外囊泡。研究对象涵盖肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤患者。研究观察到,新诊断脑转移患者与无脑转移患者及健康对照相比,循环颗粒数量更低,小细胞外囊泡中蛋白浓度更高。在所有分析组中,伴脑转移的黑色素瘤患者表现为循环中STAT3活化降低和PD-L1水平升高。数据集主题标签为 Proteomics。除上述内容外,源站未提供更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述表明研究采集的是患者血浆循环细胞外囊泡,分析队列为92例不同实体瘤患者,瘤种包括肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤,并涉及与无脑转移患者及健康对照的比较。关于具体的样本采集流程、时间跨度、机构信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集可用于了解转移性实体瘤及新诊断脑转移患者血浆循环小细胞外囊泡的特征,涉及循环颗粒数量、小细胞外囊泡蛋白浓度等观察指标,并可用于关注黑色素瘤脑转移患者中STAT3活化与PD-L1水平变化的分析场景。其主题标签为 Proteomics,适合与蛋白质组学相关的生物标志物发现研究背景相结合。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站描述提及研究队列为92例不同实体瘤患者,并包含与无脑转移患者及健康对照的比较,但未提供样本量分组细节、统计方法、数据完整性或质量控制等信息。关于数据质量与使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000098356

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑转移对近50%的肿瘤患者而言,其结局和生活质量至关重要,通常与不良的短期预后相关。对该并发症的早期或预防性诊断仍是一项未被满足的需求。有必要发现有助于预测疾病结局的新生物标志物。在本研究中,我们分析了92例不同实体瘤(肺癌、乳腺癌、肾癌和黑色素瘤)患者队列的血浆循环细胞外囊泡(EVs),发现与新诊断的无脑转移患者及健康对照相比,伴有脑转移的新诊断患者循环颗粒数量较低,且小细胞外囊泡(sEVs)中蛋白质浓度较高。在所有分析组中,与无中枢神经系统转移的患者相比,伴有脑转移的黑色素瘤患者循环sEVs中STAT3活化降低、PD-L1水平升高。

本研究提供的数据表明,循环sEVs可能代表新诊断脑转移瘤的免疫抑制状态,其特征为磷酸化STAT3(pSTAT3)降低和PD-L1升高,尽管循环sEVs中这些分子的来源仍有待揭示。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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