黑色素瘤癌症微阵列meta数据集
该数据集是一个黑色素瘤微阵列meta数据集，共包含214个样本，涵盖原发肿瘤与无肿瘤黑色素瘤组织，来自四个独立的GEO数据集
基本信息
资源简介
黑色素瘤癌症微阵列meta数据集
该数据集是一个黑色素瘤微阵列meta数据集，共包含214个样本，涵盖原发肿瘤与无肿瘤黑色素瘤组织，来自四个独立的GEO数据集。为减少平台间差异，仅纳入GPL570平台（Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array）生成的数据。各数据集经RMA标准化预处理、合并，并通过Combat方法进行批次效应校正。样本量增加后，该meta数据集可作为发现疾病表型差异表达基因的优质发现队列，适用于转录组学分析与分类研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们提出了一个meta数据集，共包含214个样本，涵盖原发肿瘤和无肿瘤黑色素瘤组织，来自四个独立的GEO数据集。为尽量减少平台间差异，仅处理由GPL570平台（Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array）生成的数据集以开发该meta数据集。使用在我们先前开发的生物信息学流程中实现的多个开源R包，每个数据集均经过RMA标准化预处理、合并，并通过Combat方法进行批次效应校正。随着样本量的增加，本meta数据集可作为发现疾病表型差异表达的优质“发现队列”。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6697
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6697
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们呈现了一个包含214个样本的元数据集，其中包括原发肿瘤和无肿瘤黑色素瘤组织，这些样本来自四个独立的GEO数据集。为了最小化平台间差异，仅处理了由GPL570平台（Affymetrix人类基因组U133 Plus 2.0阵列）生成的数据集，以开发此元数据集。利用我们先前开发的生物信息学管道中实施的多个开源R包，每个数据集都经过了RMA归一化预处理、合并，并通过Combat方法进行了批次效应校正。随着样本量的增加，当前的元数据集作为发现疾病表型中差异表达的‘发现队列’表现出色。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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